Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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