Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 CWC2YDL209C 1020 nt3.99□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 BTT1YDR252W 450 nt3.99□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.99□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.99□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.99□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.99□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.99□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.99□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.99□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.99□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.99□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.99□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 YIP5YGL161C 933 nt3.99□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 DOG2YHR043C 741 nt3.99□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 DOG1YHR044C 741 nt3.99□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 COX6YHR051W 447 nt3.99□□□□□ -1.77 RIP-Chip
PUF2Q12221 YHR173CYHR173C 339 nt3.99□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 PCL7YIL050W 858 nt3.99□□□□□ -1.77 RIP-Chip
PUF2Q12221 IST3YIR005W 447 nt3.99□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 YLR444CYLR444C 303 nt3.99□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 SIW14YNL032W 846 nt3.99□□□□□ -1.77 RIP-Chip
PUF2Q12221 DUG3YNL191W 1074 nt3.99□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 MCK1YNL307C 1128 nt3.99□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 YPL162CYPL162C 822 nt3.99□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 OXR1YPL196W 822 nt3.99□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 YPR174CYPR174C 666 nt3.99□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt3.99□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 GAT2YMR136W 1683 nt3.99□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 CHL1YPL008W 2586 nt3.99□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 PPQ1YPL179W 1650 nt3.98□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt3.98□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 YKL162CYKL162C 1209 nt3.98□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 POP3YNL282W 588 nt3.98□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 TAF14YPL129W 735 nt3.98□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 MUD1YBR119W 897 nt3.98□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 SWP82YFL049W 1872 nt3.98□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 YML020WYML020W 1995 nt3.98□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 NUG1YER006W 1563 nt3.97□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 PST1YDR055W 1335 nt3.97□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 SUP45YBR143C 1314 nt3.97□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 BIK1YCL029C 1323 nt3.97□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 MSW1YDR268W 1140 nt3.97□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 MAG1YER142C 891 nt3.97□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 YFH7YFR007W 1062 nt3.97□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 YGL214WYGL214W 486 nt3.97□□□□□ -1.77 RIP-Chip
PUF2Q12221 PRE9YGR135W 777 nt3.97□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 CAB2YIL083C 1098 nt3.97□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 MAP1YLR244C 1164 nt3.97□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 MRPL16YBL038W 699 nt3.97□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 YPR177CYPR177C 372 nt3.97□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 USA1YML029W 2517 nt3.97□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 SPB4YFL002C 1821 nt3.97□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 HPR1YDR138W 2259 nt3.97□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 RDH54YBR073W 2877 nt3.96□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 YNR066CYNR066C 1311 nt3.96□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 KIC1YHR102W 3243 nt3.96□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 SRP72YPL210C 1923 nt3.96□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 YCR085WYCR085W 354 nt3.96□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 RPN9YDR427W 1182 nt3.96□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 PRP38YGR075C 729 nt3.96□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 RPL8AYHL033C 771 nt3.96□□□□□ -1.78 RIP-Chip
PUF2Q12221 AIM19YIL087C 474 nt3.96□□□□□ -1.78 RIP-Chip
PUF2Q12221 TOM7YNL070W 183 nt3.96□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 RPC34YNR003C 954 nt3.96□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 ATG5YPL149W 885 nt3.96□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 GDT1YBR187W 843 nt3.96□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 VPS73YGL104C 1461 nt3.96□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 YBR225WYBR225W 2703 nt3.96□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 HOS3YPL116W 2094 nt3.96□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 NCR1YPL006W 3513 nt3.96□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 AIP1YMR092C 1848 nt3.95□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 SEN1YLR430W 6696 nt3.95□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 SIP1YDR422C 2448 nt3.95□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 APP1YNL094W 1764 nt3.95□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 SSL1YLR005W 1386 nt3.95□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 YDR230WYDR230W 348 nt3.95□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 YEL010WYEL010W 351 nt3.95□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 PRE1YER012W 597 nt3.95□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 ECM34YHL043W 513 nt3.95□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 COS8YHL048W 1146 nt3.95□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt3.95□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 REC102YLR329W 795 nt3.95□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 INP1YMR204C 1263 nt3.95□□□□□ -1.78 RIP-Chip
PUF2Q12221 MRPL17YNL252C 846 nt3.95□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 snR11snR11 258 nt3.95□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 MTR10YOR160W 2919 nt3.95□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 YHR202WYHR202W 1809 nt3.95□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 MCP2YLR253W 1710 nt3.95□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 MIC60YKR016W 1623 nt3.95□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 URC2YDR520C 2319 nt3.94□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 ACE2YLR131C 2313 nt3.94□□□□□ -1.78 RIP-Chip
PUF2Q12221 ERT1YBR239C 1590 nt3.94□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 ERJ5YFR041C 888 nt3.94□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 PRP18YGR006W 756 nt3.94□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 YLR456WYLR456W 615 nt3.94□□□□□ -1.78 RIP-Chip
PUF2Q12221 TRI1YMR233W 681 nt3.94□□□□□ -1.78 RIP-Chip
PUF2Q12221 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt3.94□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 YLR152CYLR152C 1731 nt3.94□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 TRS85YDR108W 2097 nt3.94□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 MSN4YKL062W 1893 nt3.94□□□□□ -1.78 RIP-Chip
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