Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms