Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
REG1BP48304 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
REG1BP48304 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
REG1BP48304 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REG1BP48304 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REG1BP48304 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REG1BP48304 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REG1BP48304 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
REG1BP48304 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
REG1BP48304 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
REG1BP48304 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
REG1BP48304 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
REG1BP48304 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
REG1BP48304 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
REG1BP48304 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REG1BP48304 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
REG1BP48304 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
REG1BP48304 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REG1BP48304 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REG1BP48304 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
REG1BP48304 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
REG1BP48304 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
REG1BP48304 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
REG1BP48304 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
REG1BP48304 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
REG1BP48304 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
REG1BP48304 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
REG1BP48304 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
REG1BP48304 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
REG1BP48304 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
REG1BP48304 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
REG1BP48304 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
REG1BP48304 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
REG1BP48304 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
REG1BP48304 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
REG1BP48304 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
REG1BP48304 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
REG1BP48304 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
REG1BP48304 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
REG1BP48304 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
REG1BP48304 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
REG1BP48304 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
REG1BP48304 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
REG1BP48304 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
REG1BP48304 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
REG1BP48304 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
REG1BP48304 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
REG1BP48304 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
REG1BP48304 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
REG1BP48304 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
REG1BP48304 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
REG1BP48304 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
REG1BP48304 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
REG1BP48304 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
REG1BP48304 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
REG1BP48304 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
REG1BP48304 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
REG1BP48304 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
REG1BP48304 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
REG1BP48304 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
REG1BP48304 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
REG1BP48304 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
REG1BP48304 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
REG1BP48304 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
REG1BP48304 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
REG1BP48304 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
REG1BP48304 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
REG1BP48304 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
REG1BP48304 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
REG1BP48304 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
REG1BP48304 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
REG1BP48304 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
REG1BP48304 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
REG1BP48304 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
REG1BP48304 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
REG1BP48304 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
REG1BP48304 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
REG1BP48304 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
REG1BP48304 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
REG1BP48304 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
REG1BP48304 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
REG1BP48304 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
REG1BP48304 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
REG1BP48304 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
REG1BP48304 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
REG1BP48304 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
REG1BP48304 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
REG1BP48304 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
REG1BP48304 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
REG1BP48304 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
REG1BP48304 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
REG1BP48304 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
REG1BP48304 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
REG1BP48304 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
REG1BP48304 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
REG1BP48304 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
REG1BP48304 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
REG1BP48304 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
REG1BP48304 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
REG1BP48304 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms