Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms