Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP19O94966 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP19O94966 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP19O94966 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP19O94966 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP19O94966 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP19O94966 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP19O94966 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP19O94966 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
USP19O94966 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP19O94966 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP19O94966 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP19O94966 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP19O94966 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP19O94966 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP19O94966 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP19O94966 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
USP19O94966 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP19O94966 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP19O94966 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP19O94966 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP19O94966 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP19O94966 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
USP19O94966 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP19O94966 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP19O94966 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP19O94966 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
USP19O94966 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP19O94966 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP19O94966 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP19O94966 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP19O94966 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP19O94966 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP19O94966 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP19O94966 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP19O94966 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP19O94966 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP19O94966 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP19O94966 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP19O94966 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP19O94966 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP19O94966 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP19O94966 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP19O94966 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP19O94966 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP19O94966 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP19O94966 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
USP19O94966 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
USP19O94966 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP19O94966 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP19O94966 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP19O94966 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP19O94966 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP19O94966 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP19O94966 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP19O94966 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP19O94966 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP19O94966 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP19O94966 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP19O94966 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP19O94966 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP19O94966 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP19O94966 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP19O94966 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP19O94966 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP19O94966 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP19O94966 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
USP19O94966 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP19O94966 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP19O94966 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP19O94966 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP19O94966 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP19O94966 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP19O94966 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP19O94966 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP19O94966 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP19O94966 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP19O94966 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
USP19O94966 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
USP19O94966 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP19O94966 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP19O94966 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP19O94966 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
USP19O94966 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP19O94966 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP19O94966 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP19O94966 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP19O94966 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP19O94966 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP19O94966 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP19O94966 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP19O94966 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP19O94966 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP19O94966 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP19O94966 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP19O94966 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP19O94966 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP19O94966 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
USP19O94966 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP19O94966 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms