Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.1 ms