Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.26
TNIKQ9UKE5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
TNIKQ9UKE5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TNIKQ9UKE5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TNIKQ9UKE5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TNIKQ9UKE5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TNIKQ9UKE5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
TNIKQ9UKE5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TNIKQ9UKE5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TNIKQ9UKE5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TNIKQ9UKE5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TNIKQ9UKE5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TNIKQ9UKE5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TNIKQ9UKE5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TNIKQ9UKE5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TNIKQ9UKE5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TNIKQ9UKE5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TNIKQ9UKE5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TNIKQ9UKE5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms