Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID3

VPS51, Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS51Q9UID3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS51Q9UID3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VPS51Q9UID3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VPS51Q9UID3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS51Q9UID3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS51Q9UID3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS51Q9UID3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS51Q9UID3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS51Q9UID3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS51Q9UID3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS51Q9UID3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS51Q9UID3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS51Q9UID3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS51Q9UID3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS51Q9UID3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS51Q9UID3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS51Q9UID3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS51Q9UID3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS51Q9UID3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS51Q9UID3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS51Q9UID3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS51Q9UID3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS51Q9UID3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms