Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms