Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLMNQ96JQ2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms