Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms