Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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