Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms