Protein–RNA interactions for Protein: Q2MV58

TCTN1, Tectonic-1, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN1Q2MV58 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCTN1Q2MV58 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms