Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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