Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1CQ15572 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms