Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
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