Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPB1P53618 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPB1P53618 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPB1P53618 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPB1P53618 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPB1P53618 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPB1P53618 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPB1P53618 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPB1P53618 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPB1P53618 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPB1P53618 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPB1P53618 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPB1P53618 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB1P53618 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB1P53618 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB1P53618 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB1P53618 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB1P53618 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB1P53618 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB1P53618 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB1P53618 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB1P53618 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB1P53618 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB1P53618 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB1P53618 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB1P53618 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB1P53618 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
COPB1P53618 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COPB1P53618 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COPB1P53618 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COPB1P53618 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COPB1P53618 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPB1P53618 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPB1P53618 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPB1P53618 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPB1P53618 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPB1P53618 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPB1P53618 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPB1P53618 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPB1P53618 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPB1P53618 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPB1P53618 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPB1P53618 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPB1P53618 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPB1P53618 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPB1P53618 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPB1P53618 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPB1P53618 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPB1P53618 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPB1P53618 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPB1P53618 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPB1P53618 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPB1P53618 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPB1P53618 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPB1P53618 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPB1P53618 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPB1P53618 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPB1P53618 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPB1P53618 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPB1P53618 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPB1P53618 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPB1P53618 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPB1P53618 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPB1P53618 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPB1P53618 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPB1P53618 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPB1P53618 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPB1P53618 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPB1P53618 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COPB1P53618 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB1P53618 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB1P53618 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB1P53618 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB1P53618 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB1P53618 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB1P53618 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB1P53618 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB1P53618 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB1P53618 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB1P53618 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPB1P53618 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPB1P53618 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPB1P53618 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPB1P53618 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPB1P53618 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPB1P53618 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPB1P53618 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COPB1P53618 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPB1P53618 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPB1P53618 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPB1P53618 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPB1P53618 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPB1P53618 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPB1P53618 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPB1P53618 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPB1P53618 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPB1P53618 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPB1P53618 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPB1P53618 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPB1P53618 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms