Protein–RNA interactions for Protein: P39059

COL15A1, Collagen alpha-1(XV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL15A1P39059 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL15A1P39059 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
COL15A1P39059 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
COL15A1P39059 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL15A1P39059 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
COL15A1P39059 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL15A1P39059 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL15A1P39059 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL15A1P39059 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL15A1P39059 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL15A1P39059 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
COL15A1P39059 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
COL15A1P39059 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.57■■■□□ 2
COL15A1P39059 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
COL15A1P39059 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
COL15A1P39059 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
COL15A1P39059 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
COL15A1P39059 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL15A1P39059 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL15A1P39059 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
COL15A1P39059 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL15A1P39059 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COL15A1P39059 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL15A1P39059 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
COL15A1P39059 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL15A1P39059 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.56■■■□□ 2
COL15A1P39059 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
COL15A1P39059 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
COL15A1P39059 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL15A1P39059 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL15A1P39059 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
COL15A1P39059 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL15A1P39059 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL15A1P39059 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.55■■■□□ 2
COL15A1P39059 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
COL15A1P39059 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
COL15A1P39059 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.55■■■□□ 2
COL15A1P39059 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL15A1P39059 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
COL15A1P39059 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
COL15A1P39059 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL15A1P39059 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL15A1P39059 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL15A1P39059 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms