Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTNP21246 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTNP21246 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTNP21246 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTNP21246 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTNP21246 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTNP21246 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTNP21246 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTNP21246 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTNP21246 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTNP21246 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTNP21246 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTNP21246 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTNP21246 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTNP21246 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTNP21246 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTNP21246 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTNP21246 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTNP21246 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTNP21246 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTNP21246 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTNP21246 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTNP21246 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTNP21246 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTNP21246 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTNP21246 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTNP21246 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTNP21246 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTNP21246 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTNP21246 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTNP21246 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTNP21246 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTNP21246 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTNP21246 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTNP21246 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTNP21246 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTNP21246 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTNP21246 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTNP21246 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTNP21246 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTNP21246 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTNP21246 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTNP21246 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTNP21246 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTNP21246 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTNP21246 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTNP21246 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTNP21246 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTNP21246 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTNP21246 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTNP21246 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTNP21246 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTNP21246 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTNP21246 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTNP21246 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTNP21246 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTNP21246 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTNP21246 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTNP21246 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTNP21246 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTNP21246 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTNP21246 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTNP21246 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTNP21246 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTNP21246 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTNP21246 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTNP21246 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTNP21246 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTNP21246 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTNP21246 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTNP21246 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTNP21246 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTNP21246 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTNP21246 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTNP21246 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTNP21246 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTNP21246 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTNP21246 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTNP21246 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTNP21246 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTNP21246 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTNP21246 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTNP21246 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTNP21246 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTNP21246 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTNP21246 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTNP21246 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTNP21246 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTNP21246 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTNP21246 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTNP21246 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTNP21246 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTNP21246 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTNP21246 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTNP21246 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTNP21246 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTNP21246 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTNP21246 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTNP21246 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTNP21246 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms