Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN2P0C2S0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTXN2P0C2S0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN2P0C2S0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN2P0C2S0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN2P0C2S0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN2P0C2S0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN2P0C2S0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN2P0C2S0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN2P0C2S0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN2P0C2S0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN2P0C2S0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN2P0C2S0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN2P0C2S0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN2P0C2S0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN2P0C2S0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN2P0C2S0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN2P0C2S0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN2P0C2S0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN2P0C2S0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN2P0C2S0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN2P0C2S0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN2P0C2S0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN2P0C2S0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN2P0C2S0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms