Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 ARMC6-217ENST00000541898 1198 ntTSL 222.45■■□□□ 1.181e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 ARMC6-204ENST00000535288 622 ntTSL 422.45■■□□□ 1.181e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 ARMC6-209ENST00000536098 563 ntTSL 522.4■■□□□ 1.181e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 MAFF-205ENST00000441709 548 ntTSL 222.2■■□□□ 1.141e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.131e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.091e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 SLC6A6-205ENST00000613930 988 ntTSL 221.87■■□□□ 1.091e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 KATNB1-204ENST00000563127 733 ntTSL 221.82■■□□□ 1.082e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.081e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.061e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.031e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.982e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 ARMC6-210ENST00000537263 1318 ntTSL 321.19■□□□□ 0.981e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 SLC6A6-203ENST00000610642 1983 ntTSL 221.08■□□□□ 0.971e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.941e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.942e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 TBC1D5-221ENST00000452492 581 ntTSL 320.62■□□□□ 0.891e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.861e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 GMDS-AS1-206ENST00000530346 594 ntTSL 420.38■□□□□ 0.851e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 TBC1D5-203ENST00000414318 2088 ntTSL 520.28■□□□□ 0.841e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.832e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.815e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.811e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 C1orf159-212ENST00000467751 2099 ntTSL 220.04■□□□□ 0.83e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 C1orf159-213ENST00000472741 661 ntTSL 420.03■□□□□ 0.83e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 MAFF-203ENST00000417948 697 ntTSL 420■□□□□ 0.791e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 C1orf159-218ENST00000482816 982 ntTSL 519.84■□□□□ 0.773e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.743e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.741e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 SLC6A6-209ENST00000622176 1116 ntTSL 1 (best)19.6■□□□□ 0.731e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.691e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 C1orf159-207ENST00000434641 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.32■□□□□ 0.683e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 ARMC6-219ENST00000545091 1079 ntTSL 519.3■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.661e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.651e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.642e-8■■■■■ 30
DKC1O60832 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.631e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.633e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 SLC6A6-206ENST00000615188 689 ntTSL 318.67■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 GMDS-AS1-211ENST00000533653 568 ntTSL 218.49■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.541e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 C1orf159-203ENST00000379325 2010 ntTSL 218.2■□□□□ 0.53e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.461e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 KATNB1-203ENST00000562592 853 ntTSL 317.83■□□□□ 0.442e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 HERC2P9-207ENST00000530420 2257 ntTSL 517.42■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 C1orf159-217ENST00000480643 579 ntTSL 417.28■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 WNK2-203ENST00000411624 6679 ntTSL 1 (best)17.12■□□□□ 0.335e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 ARHGEF40-202ENST00000553709 5204 ntTSL 1 (best)17■□□□□ 0.311e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 MTMR3-207ENST00000445401 665 ntTSL 316.98■□□□□ 0.311e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 C1orf159-215ENST00000475119 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.69■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 ARHGEF40-203ENST00000554514 2928 ntTSL 1 (best)16.69■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 KATNB1-206ENST00000566611 3854 ntTSL 216.62■□□□□ 0.252e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 C1orf159-209ENST00000462097 836 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.6■□□□□ 0.253e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 ARMC6-215ENST00000540792 951 ntTSL 216.3■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 ARHGEF40-207ENST00000556399 4902 ntTSL 1 (best)16.24■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 ARHGEF40-208ENST00000557498 794 ntTSL 216.13■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 CDHR2-207ENST00000513031 849 ntTSL 315.94■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 NASP-208ENST00000470768 1036 ntTSL 315.87■□□□□ 0.132e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 KATNB1-207ENST00000566726 728 ntTSL 315.49■□□□□ 0.072e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 NASP-207ENST00000464190 604 ntTSL 215.48■□□□□ 0.072e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 CDHR2-204ENST00000508085 577 ntTSL 215.41■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 TBC1D5-206ENST00000423331 588 ntTSL 415.38■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 GNA12-208ENST00000496740 2450 ntTSL 215.36■□□□□ 0.052e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 EIF2AK4-206ENST00000559032 1089 ntTSL 515.35■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 ACVR1-206ENST00000424669 550 ntTSL 415.25■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.022e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 ARMC6-216ENST00000541725 560 ntTSL 514.93□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 RAP1GAP-213ENST00000611549 4294 ntTSL 514.89□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 GNA12-205ENST00000471281 1205 ntTSL 314.88□□□□□ -0.032e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 TBC1D5-226ENST00000481396 609 ntTSL 414.83□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 TBC1D5-216ENST00000444471 680 ntTSL 314.83□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 EIF2AK4-210ENST00000560855 4789 ntTSL 514.66□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 GMDS-AS1-208ENST00000531092 744 ntTSL 314.48□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 IFITM10-202ENST00000382123 3807 ntTSL 314.45□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 COPS7B-210ENST00000413197 2442 ntTSL 214.31□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 EPB41L2-204ENST00000392427 3369 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.135e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 EPB41L2-205ENST00000445890 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.145e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 C1orf159-216ENST00000477196 3214 ntTSL 214.08□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 ARMC6-212ENST00000539985 1252 ntTSL 213.94□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 TBC1D5-207ENST00000425944 591 ntTSL 413.89□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 30
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