RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472741.5

C1orf159-213, Transcript of chromosome 1 open reading frame 159, humanhuman

TSL 4

Gene C1orf159, Length 661 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf159-213ENST00000472741 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.72■■■■■ 4.91
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C1orf159-213ENST00000472741 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.18■■■■□ 3.86
C1orf159-213ENST00000472741 NACADO15069 1562 aa38.84■■■■□ 3.81
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C1orf159-213ENST00000472741 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.56■■■■□ 3.76
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C1orf159-213ENST00000472741 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.16■■■■□ 3.7
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C1orf159-213ENST00000472741 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.64■■■■□ 3.62
C1orf159-213ENST00000472741 SCRIBQ14160 1630 aa37.54■■■■□ 3.6
C1orf159-213ENST00000472741 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.4■■■■□ 3.58
C1orf159-213ENST00000472741 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.34■■■■□ 3.57
C1orf159-213ENST00000472741 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.26■■■■□ 3.55
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C1orf159-213ENST00000472741 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.97■■■■□ 3.35
C1orf159-213ENST00000472741 NCAPD3P42695 1498 aa35.9■■■■□ 3.34
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C1orf159-213ENST00000472741 SMARCA4P51532 1647 aa35.74■■■■□ 3.31
C1orf159-213ENST00000472741 ERCC6Q03468 1493 aa35.65■■■■□ 3.3
C1orf159-213ENST00000472741 CUX2O14529 1486 aa35.61■■■■□ 3.29
C1orf159-213ENST00000472741 SMARCA2P51531 1590 aa35.59■■■■□ 3.29
C1orf159-213ENST00000472741 NESP48681 1621 aa35.59■■■■□ 3.29
C1orf159-213ENST00000472741 HMGXB3Q12766 1538 aa35.57■■■■□ 3.29
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C1orf159-213ENST00000472741 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.33■■■■□ 3.25
C1orf159-213ENST00000472741 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.32■■■■□ 3.24
C1orf159-213ENST00000472741 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
C1orf159-213ENST00000472741 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.11■■■■□ 3.21
C1orf159-213ENST00000472741 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.11■■■■□ 3.21
C1orf159-213ENST00000472741 WIZO95785 1651 aa34.93■■■■□ 3.18
C1orf159-213ENST00000472741 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.86■■■■□ 3.17
C1orf159-213ENST00000472741 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.8■■■■□ 3.16
C1orf159-213ENST00000472741 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.64■■■■□ 3.14
C1orf159-213ENST00000472741 WDR62O43379 1518 aa34.59■■■■□ 3.13
C1orf159-213ENST00000472741 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.11
C1orf159-213ENST00000472741 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.45■■■■□ 3.1
C1orf159-213ENST00000472741 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.44■■■■□ 3.1
C1orf159-213ENST00000472741 CFTRP13569 1480 aa34.37■■■■□ 3.09
C1orf159-213ENST00000472741 TRIM41Q8WV44 630 aa34.36■■■■□ 3.09
C1orf159-213ENST00000472741 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
C1orf159-213ENST00000472741 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
C1orf159-213ENST00000472741 PRDM2Q13029 1718 aa34.07■■■■□ 3.04
C1orf159-213ENST00000472741 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.01■■■■□ 3.04
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C1orf159-213ENST00000472741 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.89■■■■□ 3.02
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C1orf159-213ENST00000472741 IFT140Q96RY7 1462 aa33.75■■■□□ 2.99
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C1orf159-213ENST00000472741 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.71■■■□□ 2.99
C1orf159-213ENST00000472741 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.71■■■□□ 2.99
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C1orf159-213ENST00000472741 CHD1O14646 1710 aa33.5■■■□□ 2.95
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C1orf159-213ENST00000472741 FBLN2P98095 1184 aa33.3■■■□□ 2.92
C1orf159-213ENST00000472741 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
C1orf159-213ENST00000472741 SOGA1O94964 1423 aa33.25■■■□□ 2.91
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C1orf159-213ENST00000472741 CEP170Q5SW79 1584 aa32.53■■■□□ 2.8
C1orf159-213ENST00000472741 ADAMTS12P58397 1594 aa32.53■■■□□ 2.8
C1orf159-213ENST00000472741 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.52■■■□□ 2.8
C1orf159-213ENST00000472741 TOP2BQ02880 1626 aa32.51■■■□□ 2.8
C1orf159-213ENST00000472741 NUP160Q12769 1436 aa32.44■■■□□ 2.78
C1orf159-213ENST00000472741 SHROOM2Q13796 1616 aa32.37■■■□□ 2.77
C1orf159-213ENST00000472741 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.35■■■□□ 2.77
C1orf159-213ENST00000472741 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.3■■■□□ 2.76
C1orf159-213ENST00000472741 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
C1orf159-213ENST00000472741 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.16■■■□□ 2.74
C1orf159-213ENST00000472741 JPH4Q96JJ6 628 aa32.13■■■□□ 2.73
C1orf159-213ENST00000472741 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.09■■■□□ 2.73
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