Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUL3

STAU2, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAU2Q9NUL3 SEPT9-234ENST00000590938 611 ntTSL 410.47□□□□□ -0.733e-6■■■□□ 18.9
STAU2Q9NUL3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.763e-6■■■□□ 18.8
STAU2Q9NUL3 RANBP1-210ENST00000435265 1879 ntTSL 220.39■□□□□ 0.863e-6■■■□□ 18.8
STAU2Q9NUL3 RANBP1-207ENST00000423859 832 ntTSL 318.65■□□□□ 0.583e-6■■■□□ 18.8
STAU2Q9NUL3 RANBP1-205ENST00000418705 932 ntTSL 316.81■□□□□ 0.283e-6■■■□□ 18.8
STAU2Q9NUL3 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.023e-6■■■□□ 18.8
STAU2Q9NUL3 RANBP1-203ENST00000411892 584 ntTSL 215.15■□□□□ 0.023e-6■■■□□ 18.8
STAU2Q9NUL3 RANBP1-211ENST00000448394 688 ntTSL 214.85□□□□□ -0.033e-6■■■□□ 18.8
STAU2Q9NUL3 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.043e-6■■■□□ 18.8
STAU2Q9NUL3 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.097e-7■■■□□ 18.7
STAU2Q9NUL3 RPS15A-209ENST00000573554 606 ntTSL 1 (best)16.9■□□□□ 0.35e-6■■■□□ 18.6
STAU2Q9NUL3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.175e-6■■■□□ 18.6
STAU2Q9NUL3 PACSIN2-210ENST00000453643 818 ntTSL 516.06■□□□□ 0.165e-6■■■□□ 18.6
STAU2Q9NUL3 IGF1R-210ENST00000559925 2280 ntTSL 1 (best)15.41■□□□□ 0.065e-6■■■□□ 18.6
STAU2Q9NUL3 RPS15A-201ENST00000322989 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.475e-6■■■□□ 18.6
STAU2Q9NUL3 IGF1R-204ENST00000558355 572 ntTSL 211.34□□□□□ -0.595e-6■■■□□ 18.6
STAU2Q9NUL3 IGF1R-201ENST00000268035 11803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.615e-6■■■□□ 18.6
STAU2Q9NUL3 PACSIN2-208ENST00000445706 511 ntTSL 511.21□□□□□ -0.615e-6■■■□□ 18.6
STAU2Q9NUL3 IGF1R-203ENST00000557938 574 ntTSL 49.82□□□□□ -0.845e-6■■■□□ 18.6
STAU2Q9NUL3 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.15e-6■■■□□ 18.6
STAU2Q9NUL3 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.265e-6■■■□□ 18.6
STAU2Q9NUL3 RPS15A-208ENST00000572008 797 ntTSL 56.55□□□□□ -1.365e-6■■■□□ 18.6
STAU2Q9NUL3 RPS15A-212ENST00000576008 589 ntTSL 1 (best)5.79□□□□□ -1.485e-6■■■□□ 18.6
STAU2Q9NUL3 RPS15A-202ENST00000562935 427 ntTSL 25.71□□□□□ -1.55e-6■■■□□ 18.6
STAU2Q9NUL3 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.55e-6■■■□□ 18.6
STAU2Q9NUL3 RPS15A-207ENST00000569365 481 ntTSL 34.52□□□□□ -1.695e-6■■■□□ 18.6
STAU2Q9NUL3 RPS15A-210ENST00000574723 418 ntTSL 33.61□□□□□ -1.835e-6■■■□□ 18.6
STAU2Q9NUL3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.662e-6■■■□□ 18.6
STAU2Q9NUL3 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.22e-6■■■□□ 18.6
STAU2Q9NUL3 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.22e-6■■■□□ 18.6
STAU2Q9NUL3 GAK-204ENST00000504435 4346 ntTSL 212.18□□□□□ -0.463e-7■■■□□ 18.6
STAU2Q9NUL3 MCF2L-218ENST00000442625 2710 ntTSL 1 (best)14.61□□□□□ -0.074e-6■■■□□ 18.4
STAU2Q9NUL3 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.42e-6■■■□□ 18.3
STAU2Q9NUL3 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.422e-6■■■□□ 18.3
STAU2Q9NUL3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.412e-9■■■□□ 18.2
STAU2Q9NUL3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.858e-6■■■□□ 18.2
STAU2Q9NUL3 SHANK2-213ENST00000460048 736 ntTSL 516.7■□□□□ 0.268e-6■■■□□ 18.2
STAU2Q9NUL3 TNS1-216ENST00000480665 758 ntTSL 215.06■□□□□ 08e-6■■■□□ 18.2
STAU2Q9NUL3 TNS1-204ENST00000413554 1478 ntTSL 514.68□□□□□ -0.068e-6■■■□□ 18.2
STAU2Q9NUL3 TNS1-210ENST00000446903 2464 ntTSL 1 (best)14.44□□□□□ -0.18e-6■■■□□ 18.2
STAU2Q9NUL3 PVT1-203ENST00000513868 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.261e-6■■■□□ 18.2
STAU2Q9NUL3 TNS1-214ENST00000479185 2513 ntTSL 513.21□□□□□ -0.298e-6■■■□□ 18.2
STAU2Q9NUL3 INSR-205ENST00000598216 2961 ntTSL 1 (best)12.46□□□□□ -0.418e-6■■■□□ 18.2
STAU2Q9NUL3 INSR-202ENST00000341500 8954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.868e-6■■■□□ 18.2
STAU2Q9NUL3 PVT1-217ENST00000523190 443 ntTSL 37.01□□□□□ -1.291e-6■■■□□ 18.2
STAU2Q9NUL3 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.311e-6■■■□□ 18.2
STAU2Q9NUL3 PVT1-211ENST00000521600 408 ntTSL 24.05□□□□□ -1.761e-6■■■□□ 18.2
STAU2Q9NUL3 PVT1-202ENST00000512617 383 ntTSL 33.11□□□□□ -1.911e-6■■■□□ 18.2
STAU2Q9NUL3 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.164e-7■■■□□ 18
STAU2Q9NUL3 PIGT-255ENST00000640175 1429 ntTSL 213.54□□□□□ -0.244e-7■■■□□ 18
STAU2Q9NUL3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.271e-6■■■□□ 17.9
STAU2Q9NUL3 SLC17A9-202ENST00000370351 3580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.251e-6■■■□□ 17.9
STAU2Q9NUL3 SLC17A9-207ENST00000488738 3992 ntTSL 213.42□□□□□ -0.261e-6■■■□□ 17.9
STAU2Q9NUL3 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.011e-20■■■□□ 17.9
STAU2Q9NUL3 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.041e-20■■■□□ 17.9
STAU2Q9NUL3 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.361e-20■■■□□ 17.9
STAU2Q9NUL3 TMBIM6-201ENST00000267115 2836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.861e-20■■■□□ 17.9
STAU2Q9NUL3 TMBIM6-209ENST00000547798 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.151e-20■■■□□ 17.9
STAU2Q9NUL3 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.281e-20■■■□□ 17.9
STAU2Q9NUL3 GSE1-204ENST00000411612 872 ntTSL 522.1■■□□□ 1.135e-7■■■□□ 17.8
STAU2Q9NUL3 GSE1-216ENST00000637419 2683 ntTSL 520.78■□□□□ 0.925e-7■■■□□ 17.8
STAU2Q9NUL3 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.15e-7■■■□□ 17.8
STAU2Q9NUL3 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.175e-7■■■□□ 17.8
STAU2Q9NUL3 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.255e-7■■■□□ 17.8
STAU2Q9NUL3 GSE1-215ENST00000635906 666 ntTSL 312.77□□□□□ -0.375e-7■■■□□ 17.8
STAU2Q9NUL3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.267e-7■■■□□ 17.8
STAU2Q9NUL3 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.057e-7■■■□□ 17.8
STAU2Q9NUL3 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.047e-7■■■□□ 17.8
STAU2Q9NUL3 DLGAP4-AS1-201ENST00000425233 443 ntTSL 515.89■□□□□ 0.138e-6■■■□□ 17.7
STAU2Q9NUL3 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.398e-6■■■□□ 17.7
STAU2Q9NUL3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.252e-6■■■□□ 17.4
STAU2Q9NUL3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.22e-6■■■□□ 17.4
STAU2Q9NUL3 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.022e-6■■■□□ 17.4
STAU2Q9NUL3 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.222e-6■■■□□ 17.4
STAU2Q9NUL3 TAF4-207ENST00000608887 284 ntTSL 48.67□□□□□ -1.029e-7■■■□□ 17.3
STAU2Q9NUL3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.335e-7■■■□□ 17.2
STAU2Q9NUL3 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.035e-7■■■□□ 17.2
STAU2Q9NUL3 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.25e-7■■■□□ 17.2
STAU2Q9NUL3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.941e-6■■■□□ 17.2
STAU2Q9NUL3 AGPAT3-207ENST00000445582 582 ntTSL 313.03□□□□□ -0.323e-6■■■□□ 17.2
STAU2Q9NUL3 AGPAT3-208ENST00000448287 454 ntTSL 312.76□□□□□ -0.373e-6■■■□□ 17.2
STAU2Q9NUL3 TAF4-203ENST00000474089 532 ntTSL 219.67■□□□□ 0.741e-6■■■□□ 17.2
STAU2Q9NUL3 TAF4-202ENST00000436129 2440 ntTSL 215.87■□□□□ 0.131e-6■■■□□ 17.2
STAU2Q9NUL3 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.232e-6■■■□□ 17.2
STAU2Q9NUL3 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.232e-6■■■□□ 17.2
STAU2Q9NUL3 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.422e-6■■■□□ 17.2
STAU2Q9NUL3 TNS1-221ENST00000615025 6488 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.582e-6■■■□□ 17.2
STAU2Q9NUL3 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.882e-6■■■□□ 17.2
STAU2Q9NUL3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.63e-7■■■□□ 17.1
STAU2Q9NUL3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.263e-7■■■□□ 17.1
STAU2Q9NUL3 OAZ1-203ENST00000586054 2832 nt21.31■■□□□ 13e-8■■■□□ 17
STAU2Q9NUL3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.733e-8■■■□□ 17
STAU2Q9NUL3 OAZ1-210ENST00000593012 1357 ntTSL 219.14■□□□□ 0.653e-8■■■□□ 17
STAU2Q9NUL3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.523e-8■■■□□ 17
STAU2Q9NUL3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.383e-8■■■□□ 17
STAU2Q9NUL3 OAZ1-201ENST00000581150 1131 ntTSL 517.32■□□□□ 0.363e-8■■■□□ 17
STAU2Q9NUL3 OAZ1-207ENST00000590943 1012 ntTSL 216.53■□□□□ 0.243e-8■■■□□ 17
STAU2Q9NUL3 OAZ1-208ENST00000592727 726 ntTSL 215.38■□□□□ 0.053e-8■■■□□ 17
STAU2Q9NUL3 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.414e-6■■■□□ 17
STAU2Q9NUL3 WNK2-206ENST00000448039 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)22.6■■□□□ 1.211e-6■■■□□ 16.9
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