Protein–RNA interactions for Protein: Q3E827

LSO1, Protein LSO1, yeastyeast

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSO1Q3E827 MAS1YLR163C 1389 nt9.77□□□□□ -0.84
LSO1Q3E827 YKL030WYKL030W 606 nt9.76□□□□□ -0.85
LSO1Q3E827 AHT1YHR093W 549 nt9.74□□□□□ -0.85
LSO1Q3E827 SPP1YPL138C 1062 nt9.74□□□□□ -0.85
LSO1Q3E827 YPR064WYPR064W 420 nt9.73□□□□□ -0.85
LSO1Q3E827 CCT4YDL143W 1587 nt9.72□□□□□ -0.85
LSO1Q3E827 DTR1YBR180W 1719 nt9.72□□□□□ -0.85
LSO1Q3E827 HHO1YPL127C 777 nt9.71□□□□□ -0.86
LSO1Q3E827 WSC2YNL283C 1512 nt9.71□□□□□ -0.86
LSO1Q3E827 YIR016WYIR016W 798 nt9.7□□□□□ -0.86
LSO1Q3E827 ATG17YLR423C 1254 nt9.7□□□□□ -0.86
LSO1Q3E827 VPS60YDR486C 690 nt9.69□□□□□ -0.86
LSO1Q3E827 YGR201CYGR201C 678 nt9.69□□□□□ -0.86
LSO1Q3E827 RFC1YOR217W 2586 nt9.69□□□□□ -0.86
LSO1Q3E827 SWC5YBR231C 912 nt9.68□□□□□ -0.86
LSO1Q3E827 YCL074WYCL074W 927 nt9.67□□□□□ -0.86
LSO1Q3E827 YPL071CYPL071C 471 nt9.67□□□□□ -0.86
LSO1Q3E827 GAL2YLR081W 1725 nt9.65□□□□□ -0.86
LSO1Q3E827 DUS1YML080W 1272 nt9.65□□□□□ -0.86
LSO1Q3E827 KDX1YKL161C 1302 nt9.64□□□□□ -0.87
LSO1Q3E827 YKR005CYKR005C 1578 nt9.64□□□□□ -0.87
LSO1Q3E827 TAD3YLR316C 969 nt9.63□□□□□ -0.87
LSO1Q3E827 MUP1YGR055W 1725 nt9.62□□□□□ -0.87
LSO1Q3E827 UTP6YDR449C 1323 nt9.62□□□□□ -0.87
LSO1Q3E827 THI72YOR192C 1800 nt9.62□□□□□ -0.87
LSO1Q3E827 UBX6YJL048C 1191 nt9.62□□□□□ -0.87
LSO1Q3E827 AGP1YCL025C 1902 nt9.62□□□□□ -0.87
LSO1Q3E827 ALG3YBL082C 1377 nt9.6□□□□□ -0.87
LSO1Q3E827 PUS7YOR243C 2031 nt9.58□□□□□ -0.88
LSO1Q3E827 YDR306CYDR306C 1437 nt9.58□□□□□ -0.88
LSO1Q3E827 IRC24YIR036C 792 nt9.58□□□□□ -0.88
LSO1Q3E827 TOK1YJL093C 2076 nt9.55□□□□□ -0.88
LSO1Q3E827 ARP10YDR106W 855 nt9.55□□□□□ -0.88
LSO1Q3E827 YGR259CYGR259C 441 nt9.55□□□□□ -0.88
LSO1Q3E827 RPC82YPR190C 1965 nt9.55□□□□□ -0.88
LSO1Q3E827 MCM5YLR274W 2328 nt9.55□□□□□ -0.88
LSO1Q3E827 RMA1YKL132C 1293 nt9.52□□□□□ -0.89
LSO1Q3E827 YNL165WYNL165W 1221 nt9.52□□□□□ -0.89
LSO1Q3E827 GOR1YNL274C 1053 nt9.52□□□□□ -0.89
LSO1Q3E827 YLR415CYLR415C 339 nt9.51□□□□□ -0.89
LSO1Q3E827 SWP1YMR149W 861 nt9.51□□□□□ -0.89
LSO1Q3E827 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.5□□□□□ -0.89
LSO1Q3E827 RTG1YOL067C 534 nt9.5□□□□□ -0.89
LSO1Q3E827 AVT6YER119C 1347 nt9.48□□□□□ -0.89
LSO1Q3E827 YNL115CYNL115C 1935 nt9.48□□□□□ -0.89
LSO1Q3E827 GDH3YAL062W 1374 nt9.48□□□□□ -0.89
LSO1Q3E827 SEM1YDR363W-A 270 nt9.47□□□□□ -0.89
LSO1Q3E827 STR3YGL184C 1398 nt9.47□□□□□ -0.89
LSO1Q3E827 BDH1YAL060W 1149 nt9.46□□□□□ -0.9
LSO1Q3E827 INA1YLR413W 2028 nt9.46□□□□□ -0.9
LSO1Q3E827 HUA1YGR268C 597 nt9.45□□□□□ -0.9
LSO1Q3E827 YHL008CYHL008C 1884 nt9.45□□□□□ -0.9
LSO1Q3E827 TIM17YJL143W 477 nt9.44□□□□□ -0.9
LSO1Q3E827 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.43□□□□□ -0.9
LSO1Q3E827 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.43□□□□□ -0.9
LSO1Q3E827 RTN2YDL204W 1182 nt9.42□□□□□ -0.9
LSO1Q3E827 YJL211CYJL211C 444 nt9.42□□□□□ -0.9
LSO1Q3E827 EEB1YPL095C 1371 nt9.41□□□□□ -0.9
LSO1Q3E827 NRT1YOR071C 1797 nt9.4□□□□□ -0.9
LSO1Q3E827 AQY2YLL052C 450 nt9.4□□□□□ -0.9
LSO1Q3E827 SHM2YLR058C 1410 nt9.39□□□□□ -0.91
LSO1Q3E827 ATG22YCL038C 1587 nt9.39□□□□□ -0.91
LSO1Q3E827 MRPL8YJL063C 717 nt9.38□□□□□ -0.91
LSO1Q3E827 DUT1YBR252W 444 nt9.38□□□□□ -0.91
LSO1Q3E827 YMR209CYMR209C 1374 nt9.37□□□□□ -0.91
LSO1Q3E827 HXK1YFR053C 1458 nt9.37□□□□□ -0.91
LSO1Q3E827 DAT1YML113W 747 nt9.37□□□□□ -0.91
LSO1Q3E827 AST1YBL069W 1290 nt9.37□□□□□ -0.91
LSO1Q3E827 ADO1YJR105W 1023 nt9.36□□□□□ -0.91
LSO1Q3E827 YSP3YOR003W 1437 nt9.36□□□□□ -0.91
LSO1Q3E827 COX16YJL003W 357 nt9.35□□□□□ -0.91
LSO1Q3E827 IDP3YNL009W 1263 nt9.35□□□□□ -0.91
LSO1Q3E827 HOS2YGL194C 1359 nt9.34□□□□□ -0.91
LSO1Q3E827 HOL1YNR055C 1761 nt9.33□□□□□ -0.92
LSO1Q3E827 YJL107CYJL107C 1164 nt9.33□□□□□ -0.92
LSO1Q3E827 ALD5YER073W 1563 nt9.33□□□□□ -0.92
LSO1Q3E827 YCR102CYCR102C 1107 nt9.32□□□□□ -0.92
LSO1Q3E827 SKG1YKR100C 1068 nt9.32□□□□□ -0.92
LSO1Q3E827 HEM14YER014W 1620 nt9.3□□□□□ -0.92
LSO1Q3E827 RSM23YGL129C 1353 nt9.28□□□□□ -0.92
LSO1Q3E827 MTO1YGL236C 2010 nt9.28□□□□□ -0.92
LSO1Q3E827 NIT1YIL164C 600 nt9.28□□□□□ -0.92
LSO1Q3E827 APM1YPL259C 1428 nt9.27□□□□□ -0.93
LSO1Q3E827 YMR147WYMR147W 672 nt9.26□□□□□ -0.93
LSO1Q3E827 SCO2YBR024W 906 nt9.26□□□□□ -0.93
LSO1Q3E827 VPS75YNL246W 795 nt9.25□□□□□ -0.93
LSO1Q3E827 PEX25YPL112C 1185 nt9.25□□□□□ -0.93
LSO1Q3E827 ARP6YLR085C 1317 nt9.25□□□□□ -0.93
LSO1Q3E827 NBP35YGL091C 987 nt9.24□□□□□ -0.93
LSO1Q3E827 YNR068CYNR068C 819 nt9.24□□□□□ -0.93
LSO1Q3E827 PZF1YPR186C 1290 nt9.24□□□□□ -0.93
LSO1Q3E827 SGT2YOR007C 1041 nt9.23□□□□□ -0.93
LSO1Q3E827 THP3YPR045C 1413 nt9.22□□□□□ -0.93
LSO1Q3E827 LSC2YGR244C 1284 nt9.18□□□□□ -0.94
LSO1Q3E827 PLB1YMR008C 1995 nt9.18□□□□□ -0.94
LSO1Q3E827 ILV3YJR016C 1758 nt9.17□□□□□ -0.94
LSO1Q3E827 MEP3YPR138C 1470 nt9.17□□□□□ -0.94
LSO1Q3E827 PET20YPL159C 762 nt9.17□□□□□ -0.94
LSO1Q3E827 PIC2YER053C 903 nt9.16□□□□□ -0.94
LSO1Q3E827 YBL081WYBL081W 1107 nt9.16□□□□□ -0.94
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