Protein–RNA interactions for Protein: Q12420

SNU66, 66 kDa U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein component, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNU66Q12420 TOM6YOR045W 186 nt12□□□□□ -0.49
SNU66Q12420 LSC2YGR244C 1284 nt11.98□□□□□ -0.49
SNU66Q12420 YLR111WYLR111W 333 nt11.98□□□□□ -0.49
SNU66Q12420 UTH1YKR042W 1098 nt11.97□□□□□ -0.49
SNU66Q12420 YML089CYML089C 369 nt11.97□□□□□ -0.49
SNU66Q12420 PEX2YJL210W 816 nt11.94□□□□□ -0.5
SNU66Q12420 SDH5YOL071W 489 nt11.94□□□□□ -0.5
SNU66Q12420 HIP1YGR191W 1812 nt11.94□□□□□ -0.5
SNU66Q12420 PRO1YDR300C 1287 nt11.93□□□□□ -0.5
SNU66Q12420 RAD23YEL037C 1197 nt11.89□□□□□ -0.51
SNU66Q12420 NRT1YOR071C 1797 nt11.89□□□□□ -0.51
SNU66Q12420 ARP6YLR085C 1317 nt11.88□□□□□ -0.51
SNU66Q12420 SAM1YLR180W 1149 nt11.88□□□□□ -0.51
SNU66Q12420 FUR4YBR021W 1902 nt11.88□□□□□ -0.51
SNU66Q12420 TSC10YBR265W 963 nt11.87□□□□□ -0.51
SNU66Q12420 MET28YIR017C 564 nt11.86□□□□□ -0.51
SNU66Q12420 TIF6YPR016C 738 nt11.86□□□□□ -0.51
SNU66Q12420 ATG15YCR068W 1563 nt11.86□□□□□ -0.51
SNU66Q12420 YGR012WYGR012W 1182 nt11.82□□□□□ -0.52
SNU66Q12420 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt11.81□□□□□ -0.52
SNU66Q12420 RTN2YDL204W 1182 nt11.79□□□□□ -0.52
SNU66Q12420 GAP1YKR039W 1809 nt11.79□□□□□ -0.52
SNU66Q12420 RPM1RPM1 483 nt11.78□□□□□ -0.52
SNU66Q12420 RIB3YDR487C 627 nt11.77□□□□□ -0.53
SNU66Q12420 CAB5YDR196C 726 nt11.76□□□□□ -0.53
SNU66Q12420 YLR279WYLR279W 390 nt11.75□□□□□ -0.53
SNU66Q12420 FIT3YOR383C 615 nt11.75□□□□□ -0.53
SNU66Q12420 PLB1YMR008C 1995 nt11.74□□□□□ -0.53
SNU66Q12420 YKR005CYKR005C 1578 nt11.67□□□□□ -0.54
SNU66Q12420 MSB4YOL112W 1479 nt11.67□□□□□ -0.54
SNU66Q12420 YGR259CYGR259C 441 nt11.66□□□□□ -0.54
SNU66Q12420 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt11.66□□□□□ -0.54
SNU66Q12420 DIF1YLR437C 402 nt11.63□□□□□ -0.55
SNU66Q12420 YAR028WYAR028W 705 nt11.6□□□□□ -0.55
SNU66Q12420 UTR1YJR049C 1593 nt11.59□□□□□ -0.55
SNU66Q12420 HSP60YLR259C 1719 nt11.58□□□□□ -0.56
SNU66Q12420 PRP4YPR178W 1398 nt11.58□□□□□ -0.56
SNU66Q12420 ALP1YNL270C 1722 nt11.57□□□□□ -0.56
SNU66Q12420 MTG2YHR168W 1557 nt11.54□□□□□ -0.56
SNU66Q12420 RAD51YER095W 1203 nt11.54□□□□□ -0.56
SNU66Q12420 FUN14YAL008W 597 nt11.53□□□□□ -0.56
SNU66Q12420 ZTA1YBR046C 1005 nt11.53□□□□□ -0.56
SNU66Q12420 GND1YHR183W 1470 nt11.52□□□□□ -0.56
SNU66Q12420 YPI1YFR003C 468 nt11.52□□□□□ -0.57
SNU66Q12420 YJL195CYJL195C 702 nt11.52□□□□□ -0.57
SNU66Q12420 ADH1YOL086C 1047 nt11.52□□□□□ -0.57
SNU66Q12420 AKR2YOR034C 2250 nt11.52□□□□□ -0.57
SNU66Q12420 BMT6YLR063W 1098 nt11.51□□□□□ -0.57
SNU66Q12420 STE4YOR212W 1272 nt11.51□□□□□ -0.57
SNU66Q12420 DPS1YLL018C 1674 nt11.5□□□□□ -0.57
SNU66Q12420 LOT5YKL183W 921 nt11.5□□□□□ -0.57
SNU66Q12420 FRE6YLL051C 2139 nt11.49□□□□□ -0.57
SNU66Q12420 SAM35YHR083W 990 nt11.46□□□□□ -0.57
SNU66Q12420 YLR349WYLR349W 507 nt11.46□□□□□ -0.57
SNU66Q12420 YNR029CYNR029C 1290 nt11.45□□□□□ -0.58
SNU66Q12420 IRC24YIR036C 792 nt11.44□□□□□ -0.58
SNU66Q12420 UME6YDR207C 2511 nt11.44□□□□□ -0.58
SNU66Q12420 FCY21YER060W 1587 nt11.42□□□□□ -0.58
SNU66Q12420 PRM5YIL117C 957 nt11.42□□□□□ -0.58
SNU66Q12420 AAC1YMR056C 930 nt11.42□□□□□ -0.58
SNU66Q12420 SMM1YNR015W 1155 nt11.42□□□□□ -0.58
SNU66Q12420 APT2YDR441C 546 nt11.4□□□□□ -0.58
SNU66Q12420 SED1YDR077W 1017 nt11.38□□□□□ -0.59
SNU66Q12420 YER190C-AYER190C-A 576 nt11.37□□□□□ -0.59
SNU66Q12420 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt11.37□□□□□ -0.59
SNU66Q12420 YML133W-AYML133W-A 576 nt11.37□□□□□ -0.59
SNU66Q12420 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt11.37□□□□□ -0.59
SNU66Q12420 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt11.37□□□□□ -0.59
SNU66Q12420 BOR1YNL275W 1731 nt11.37□□□□□ -0.59
SNU66Q12420 ADH7YCR105W 1086 nt11.35□□□□□ -0.59
SNU66Q12420 YEL008WYEL008W 381 nt11.35□□□□□ -0.59
SNU66Q12420 LSB3YFR024C-A 1380 nt11.33□□□□□ -0.6
SNU66Q12420 PAU15YIR041W 375 nt11.32□□□□□ -0.6
SNU66Q12420 LIP1YMR298W 453 nt11.32□□□□□ -0.6
SNU66Q12420 UGA4YDL210W 1716 nt11.31□□□□□ -0.6
SNU66Q12420 DBP1YPL119C 1854 nt11.29□□□□□ -0.6
SNU66Q12420 ALD4YOR374W 1560 nt11.28□□□□□ -0.6
SNU66Q12420 PRY1YJL079C 900 nt11.28□□□□□ -0.6
SNU66Q12420 SNF1YDR477W 1902 nt11.28□□□□□ -0.6
SNU66Q12420 RIB2YOL066C 1776 nt11.28□□□□□ -0.6
SNU66Q12420 GPN2YOR262W 1044 nt11.27□□□□□ -0.61
SNU66Q12420 HXT12YIL170W 1374 nt11.27□□□□□ -0.61
SNU66Q12420 CPD1YGR247W 720 nt11.25□□□□□ -0.61
SNU66Q12420 HXT1YHR094C 1713 nt11.23□□□□□ -0.61
SNU66Q12420 YPL251WYPL251W 303 nt11.23□□□□□ -0.61
SNU66Q12420 VRG4YGL225W 1014 nt11.22□□□□□ -0.61
SNU66Q12420 YBL086CYBL086C 1401 nt11.22□□□□□ -0.61
SNU66Q12420 LEU9YOR108W 1815 nt11.21□□□□□ -0.62
SNU66Q12420 HIF1YLL022C 1158 nt11.2□□□□□ -0.62
SNU66Q12420 BRR1YPR057W 1026 nt11.2□□□□□ -0.62
SNU66Q12420 MEP3YPR138C 1470 nt11.18□□□□□ -0.62
SNU66Q12420 YMR103CYMR103C 363 nt11.16□□□□□ -0.62
SNU66Q12420 YJL055WYJL055W 738 nt11.15□□□□□ -0.62
SNU66Q12420 TOA2YKL058W 369 nt11.15□□□□□ -0.62
SNU66Q12420 CSM1YCR086W 573 nt11.13□□□□□ -0.63
SNU66Q12420 ESS1YJR017C 513 nt11.13□□□□□ -0.63
SNU66Q12420 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt11.11□□□□□ -0.63
SNU66Q12420 SHY1YGR112W 1170 nt11.09□□□□□ -0.63
SNU66Q12420 LSB5YCL034W 1065 nt11.08□□□□□ -0.64
SNU66Q12420 BIO5YNR056C 1686 nt11.08□□□□□ -0.64
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