Protein–RNA interactions for Protein: Q12301

YDL180W, Uncharacterized membrane protein YDL180W, yeastyeast

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDL180WQ12301 RPL4AYBR031W 1089 nt8.76□□□□□ -1.01
YDL180WQ12301 CLB6YGR109C 1143 nt8.75□□□□□ -1.01
YDL180WQ12301 YML089CYML089C 369 nt8.75□□□□□ -1.01
YDL180WQ12301 RTN2YDL204W 1182 nt8.74□□□□□ -1.01
YDL180WQ12301 ALG12YNR030W 1656 nt8.73□□□□□ -1.01
YDL180WQ12301 POM34YLR018C 900 nt8.73□□□□□ -1.01
YDL180WQ12301 ARP6YLR085C 1317 nt8.72□□□□□ -1.01
YDL180WQ12301 UTH1YKR042W 1098 nt8.71□□□□□ -1.02
YDL180WQ12301 TOM6YOR045W 186 nt8.7□□□□□ -1.02
YDL180WQ12301 PRO1YDR300C 1287 nt8.69□□□□□ -1.02
YDL180WQ12301 YMR226CYMR226C 804 nt8.69□□□□□ -1.02
YDL180WQ12301 PRP4YPR178W 1398 nt8.69□□□□□ -1.02
YDL180WQ12301 RPS14BYJL191W 417 nt8.68□□□□□ -1.02
YDL180WQ12301 HIP1YGR191W 1812 nt8.68□□□□□ -1.02
YDL180WQ12301 ATG15YCR068W 1563 nt8.67□□□□□ -1.02
YDL180WQ12301 RBG2YGR173W 1107 nt8.67□□□□□ -1.02
YDL180WQ12301 YKR005CYKR005C 1578 nt8.67□□□□□ -1.02
YDL180WQ12301 YGR259CYGR259C 441 nt8.66□□□□□ -1.02
YDL180WQ12301 PEX2YJL210W 816 nt8.65□□□□□ -1.02
YDL180WQ12301 DPS1YLL018C 1674 nt8.65□□□□□ -1.03
YDL180WQ12301 NRT1YOR071C 1797 nt8.63□□□□□ -1.03
YDL180WQ12301 MET28YIR017C 564 nt8.63□□□□□ -1.03
YDL180WQ12301 YLR111WYLR111W 333 nt8.63□□□□□ -1.03
YDL180WQ12301 TIF6YPR016C 738 nt8.63□□□□□ -1.03
YDL180WQ12301 GAP1YKR039W 1809 nt8.63□□□□□ -1.03
YDL180WQ12301 BMT6YLR063W 1098 nt8.62□□□□□ -1.03
YDL180WQ12301 AAC1YMR056C 930 nt8.62□□□□□ -1.03
YDL180WQ12301 SDH5YOL071W 489 nt8.62□□□□□ -1.03
YDL180WQ12301 PLB1YMR008C 1995 nt8.62□□□□□ -1.03
YDL180WQ12301 TSC10YBR265W 963 nt8.61□□□□□ -1.03
YDL180WQ12301 RAD23YEL037C 1197 nt8.58□□□□□ -1.04
YDL180WQ12301 FIT3YOR383C 615 nt8.58□□□□□ -1.04
YDL180WQ12301 SNF1YDR477W 1902 nt8.55□□□□□ -1.04
YDL180WQ12301 YGR012WYGR012W 1182 nt8.54□□□□□ -1.04
YDL180WQ12301 IRC24YIR036C 792 nt8.52□□□□□ -1.05
YDL180WQ12301 RPM1RPM1 483 nt8.52□□□□□ -1.05
YDL180WQ12301 BIO5YNR056C 1686 nt8.52□□□□□ -1.05
YDL180WQ12301 DIF1YLR437C 402 nt8.51□□□□□ -1.05
YDL180WQ12301 UTR1YJR049C 1593 nt8.5□□□□□ -1.05
YDL180WQ12301 SAM35YHR083W 990 nt8.49□□□□□ -1.05
YDL180WQ12301 YAR028WYAR028W 705 nt8.49□□□□□ -1.05
YDL180WQ12301 YLR279WYLR279W 390 nt8.49□□□□□ -1.05
YDL180WQ12301 NAR1YNL240C 1476 nt8.49□□□□□ -1.05
YDL180WQ12301 RIB3YDR487C 627 nt8.47□□□□□ -1.05
YDL180WQ12301 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt8.46□□□□□ -1.06
YDL180WQ12301 ALP1YNL270C 1722 nt8.45□□□□□ -1.06
YDL180WQ12301 PBP1YGR178C 2169 nt8.44□□□□□ -1.06
YDL180WQ12301 SAM1YLR180W 1149 nt8.44□□□□□ -1.06
YDL180WQ12301 MSB4YOL112W 1479 nt8.43□□□□□ -1.06
YDL180WQ12301 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.42□□□□□ -1.06
YDL180WQ12301 AKR2YOR034C 2250 nt8.41□□□□□ -1.06
YDL180WQ12301 MTG2YHR168W 1557 nt8.41□□□□□ -1.06
YDL180WQ12301 PRM5YIL117C 957 nt8.41□□□□□ -1.06
YDL180WQ12301 CAB5YDR196C 726 nt8.39□□□□□ -1.07
YDL180WQ12301 CYT2YKL087C 675 nt8.38□□□□□ -1.07
YDL180WQ12301 ZTA1YBR046C 1005 nt8.38□□□□□ -1.07
YDL180WQ12301 SED1YDR077W 1017 nt8.37□□□□□ -1.07
YDL180WQ12301 ALD4YOR374W 1560 nt8.35□□□□□ -1.07
YDL180WQ12301 GND1YHR183W 1470 nt8.32□□□□□ -1.08
YDL180WQ12301 YPI1YFR003C 468 nt8.31□□□□□ -1.08
YDL180WQ12301 LOT5YKL183W 921 nt8.31□□□□□ -1.08
YDL180WQ12301 LIP1YMR298W 453 nt8.31□□□□□ -1.08
YDL180WQ12301 APT2YDR441C 546 nt8.29□□□□□ -1.08
YDL180WQ12301 FCY21YER060W 1587 nt8.29□□□□□ -1.08
YDL180WQ12301 DBP1YPL119C 1854 nt8.29□□□□□ -1.08
YDL180WQ12301 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.28□□□□□ -1.08
YDL180WQ12301 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.28□□□□□ -1.08
YDL180WQ12301 HIF1YLL022C 1158 nt8.28□□□□□ -1.08
YDL180WQ12301 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.28□□□□□ -1.08
YDL180WQ12301 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.28□□□□□ -1.08
YDL180WQ12301 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.28□□□□□ -1.08
YDL180WQ12301 HXT1YHR094C 1713 nt8.28□□□□□ -1.08
YDL180WQ12301 CMP2YML057W 1815 nt8.25□□□□□ -1.09
YDL180WQ12301 SMM1YNR015W 1155 nt8.24□□□□□ -1.09
YDL180WQ12301 YBL086CYBL086C 1401 nt8.23□□□□□ -1.09
YDL180WQ12301 ADH1YOL086C 1047 nt8.23□□□□□ -1.09
YDL180WQ12301 YJL195CYJL195C 702 nt8.22□□□□□ -1.09
YDL180WQ12301 YPL251WYPL251W 303 nt8.22□□□□□ -1.09
YDL180WQ12301 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.22□□□□□ -1.09
YDL180WQ12301 UGA4YDL210W 1716 nt8.21□□□□□ -1.09
YDL180WQ12301 FUN14YAL008W 597 nt8.21□□□□□ -1.1
YDL180WQ12301 YAT1YAR035W 2064 nt8.21□□□□□ -1.1
YDL180WQ12301 LEU9YOR108W 1815 nt8.21□□□□□ -1.1
YDL180WQ12301 YNR029CYNR029C 1290 nt8.2□□□□□ -1.1
YDL180WQ12301 PRY1YJL079C 900 nt8.19□□□□□ -1.1
YDL180WQ12301 BRR1YPR057W 1026 nt8.19□□□□□ -1.1
YDL180WQ12301 MEP3YPR138C 1470 nt8.18□□□□□ -1.1
YDL180WQ12301 TOA2YKL058W 369 nt8.17□□□□□ -1.1
YDL180WQ12301 STE4YOR212W 1272 nt8.17□□□□□ -1.1
YDL180WQ12301 HXT12YIL170W 1374 nt8.16□□□□□ -1.1
YDL180WQ12301 ZRT3YKL175W 1512 nt8.15□□□□□ -1.1
YDL180WQ12301 SHY1YGR112W 1170 nt8.14□□□□□ -1.11
YDL180WQ12301 YMR103CYMR103C 363 nt8.14□□□□□ -1.11
YDL180WQ12301 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.13□□□□□ -1.11
YDL180WQ12301 YLR349WYLR349W 507 nt8.13□□□□□ -1.11
YDL180WQ12301 YEL008WYEL008W 381 nt8.12□□□□□ -1.11
YDL180WQ12301 VRG4YGL225W 1014 nt8.11□□□□□ -1.11
YDL180WQ12301 URA6YKL024C 615 nt8.11□□□□□ -1.11
YDL180WQ12301 RIB2YOL066C 1776 nt8.11□□□□□ -1.11
YDL180WQ12301 UFO1YML088W 2007 nt8.11□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.4 ms