Protein–RNA interactions for Protein: Q07887

LDB18, Protein LDB18, yeastyeast

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB18Q07887 POM34YLR018C 900 nt10.06□□□□□ -0.8
LDB18Q07887 YML089CYML089C 369 nt10.06□□□□□ -0.8
LDB18Q07887 BMT6YLR063W 1098 nt10.04□□□□□ -0.8
LDB18Q07887 GLR1YPL091W 1452 nt10.04□□□□□ -0.8
LDB18Q07887 RPL4BYDR012W 1089 nt10.03□□□□□ -0.8
LDB18Q07887 PRO1YDR300C 1287 nt10.03□□□□□ -0.8
LDB18Q07887 TOM6YOR045W 186 nt10.03□□□□□ -0.8
LDB18Q07887 RPL4AYBR031W 1089 nt10.03□□□□□ -0.8
LDB18Q07887 CLB6YGR109C 1143 nt10.02□□□□□ -0.81
LDB18Q07887 DPS1YLL018C 1674 nt10.01□□□□□ -0.81
LDB18Q07887 ATG15YCR068W 1563 nt10□□□□□ -0.81
LDB18Q07887 YMR244WYMR244W 1068 nt9.99□□□□□ -0.81
LDB18Q07887 PLB1YMR008C 1995 nt9.99□□□□□ -0.81
LDB18Q07887 UTH1YKR042W 1098 nt9.98□□□□□ -0.81
LDB18Q07887 PEX2YJL210W 816 nt9.97□□□□□ -0.81
LDB18Q07887 HIP1YGR191W 1812 nt9.97□□□□□ -0.81
LDB18Q07887 GAP1YKR039W 1809 nt9.97□□□□□ -0.81
LDB18Q07887 RPS14BYJL191W 417 nt9.94□□□□□ -0.82
LDB18Q07887 TIF6YPR016C 738 nt9.93□□□□□ -0.82
LDB18Q07887 MET28YIR017C 564 nt9.92□□□□□ -0.82
LDB18Q07887 IRC24YIR036C 792 nt9.92□□□□□ -0.82
LDB18Q07887 AAC1YMR056C 930 nt9.92□□□□□ -0.82
LDB18Q07887 NRT1YOR071C 1797 nt9.92□□□□□ -0.82
LDB18Q07887 YMR226CYMR226C 804 nt9.87□□□□□ -0.83
LDB18Q07887 SDH5YOL071W 489 nt9.87□□□□□ -0.83
LDB18Q07887 UTR1YJR049C 1593 nt9.85□□□□□ -0.83
LDB18Q07887 TSC10YBR265W 963 nt9.85□□□□□ -0.83
LDB18Q07887 YLR111WYLR111W 333 nt9.84□□□□□ -0.83
LDB18Q07887 FIT3YOR383C 615 nt9.84□□□□□ -0.83
LDB18Q07887 RBG2YGR173W 1107 nt9.83□□□□□ -0.84
LDB18Q07887 SAM35YHR083W 990 nt9.81□□□□□ -0.84
LDB18Q07887 DIF1YLR437C 402 nt9.81□□□□□ -0.84
LDB18Q07887 SNF1YDR477W 1902 nt9.8□□□□□ -0.84
LDB18Q07887 RAD23YEL037C 1197 nt9.79□□□□□ -0.84
LDB18Q07887 YGR012WYGR012W 1182 nt9.78□□□□□ -0.84
LDB18Q07887 YAR028WYAR028W 705 nt9.78□□□□□ -0.84
LDB18Q07887 PRM5YIL117C 957 nt9.77□□□□□ -0.85
LDB18Q07887 YLR279WYLR279W 390 nt9.73□□□□□ -0.85
LDB18Q07887 ALP1YNL270C 1722 nt9.73□□□□□ -0.85
LDB18Q07887 ALG12YNR030W 1656 nt9.71□□□□□ -0.86
LDB18Q07887 ALD4YOR374W 1560 nt9.7□□□□□ -0.86
LDB18Q07887 MTG2YHR168W 1557 nt9.69□□□□□ -0.86
LDB18Q07887 AKR2YOR034C 2250 nt9.68□□□□□ -0.86
LDB18Q07887 RIB3YDR487C 627 nt9.68□□□□□ -0.86
LDB18Q07887 BIO5YNR056C 1686 nt9.67□□□□□ -0.86
LDB18Q07887 MSB4YOL112W 1479 nt9.67□□□□□ -0.86
LDB18Q07887 ZTA1YBR046C 1005 nt9.66□□□□□ -0.86
LDB18Q07887 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.66□□□□□ -0.86
LDB18Q07887 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.65□□□□□ -0.86
LDB18Q07887 SED1YDR077W 1017 nt9.64□□□□□ -0.87
LDB18Q07887 HIF1YLL022C 1158 nt9.63□□□□□ -0.87
LDB18Q07887 LIP1YMR298W 453 nt9.61□□□□□ -0.87
LDB18Q07887 CAB5YDR196C 726 nt9.6□□□□□ -0.87
LDB18Q07887 DBP1YPL119C 1854 nt9.59□□□□□ -0.87
LDB18Q07887 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.59□□□□□ -0.87
LDB18Q07887 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.59□□□□□ -0.87
LDB18Q07887 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.59□□□□□ -0.87
LDB18Q07887 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.59□□□□□ -0.87
LDB18Q07887 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.59□□□□□ -0.87
LDB18Q07887 HXT1YHR094C 1713 nt9.59□□□□□ -0.87
LDB18Q07887 MCH5YOR306C 1566 nt9.58□□□□□ -0.88
LDB18Q07887 RPM1RPM1 483 nt9.57□□□□□ -0.88
LDB18Q07887 SAM1YLR180W 1149 nt9.56□□□□□ -0.88
LDB18Q07887 GND1YHR183W 1470 nt9.53□□□□□ -0.88
LDB18Q07887 YBL086CYBL086C 1401 nt9.52□□□□□ -0.89
LDB18Q07887 FCY21YER060W 1587 nt9.51□□□□□ -0.89
LDB18Q07887 APT2YDR441C 546 nt9.51□□□□□ -0.89
LDB18Q07887 LOT5YKL183W 921 nt9.5□□□□□ -0.89
LDB18Q07887 LEU9YOR108W 1815 nt9.49□□□□□ -0.89
LDB18Q07887 YPL251WYPL251W 303 nt9.48□□□□□ -0.89
LDB18Q07887 BRR1YPR057W 1026 nt9.48□□□□□ -0.89
LDB18Q07887 ZRT3YKL175W 1512 nt9.47□□□□□ -0.89
LDB18Q07887 YPI1YFR003C 468 nt9.47□□□□□ -0.89
LDB18Q07887 SMM1YNR015W 1155 nt9.47□□□□□ -0.89
LDB18Q07887 PBP1YGR178C 2169 nt9.47□□□□□ -0.89
LDB18Q07887 TOA2YKL058W 369 nt9.46□□□□□ -0.9
LDB18Q07887 UGA4YDL210W 1716 nt9.45□□□□□ -0.9
LDB18Q07887 SHY1YGR112W 1170 nt9.45□□□□□ -0.9
LDB18Q07887 CYT2YKL087C 675 nt9.45□□□□□ -0.9
LDB18Q07887 NAR1YNL240C 1476 nt9.45□□□□□ -0.9
LDB18Q07887 MEP3YPR138C 1470 nt9.44□□□□□ -0.9
LDB18Q07887 YMR103CYMR103C 363 nt9.41□□□□□ -0.9
LDB18Q07887 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.4□□□□□ -0.9
LDB18Q07887 PRY1YJL079C 900 nt9.4□□□□□ -0.9
LDB18Q07887 ADH1YOL086C 1047 nt9.4□□□□□ -0.9
LDB18Q07887 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.39□□□□□ -0.91
LDB18Q07887 URA6YKL024C 615 nt9.39□□□□□ -0.91
LDB18Q07887 GND2YGR256W 1479 nt9.39□□□□□ -0.91
LDB18Q07887 UFO1YML088W 2007 nt9.38□□□□□ -0.91
LDB18Q07887 YNR029CYNR029C 1290 nt9.37□□□□□ -0.91
LDB18Q07887 YJL195CYJL195C 702 nt9.36□□□□□ -0.91
LDB18Q07887 OYE3YPL171C 1203 nt9.34□□□□□ -0.91
LDB18Q07887 SAM2YDR502C 1155 nt9.33□□□□□ -0.92
LDB18Q07887 FUN14YAL008W 597 nt9.33□□□□□ -0.92
LDB18Q07887 HXT12YIL170W 1374 nt9.33□□□□□ -0.92
LDB18Q07887 SSN3YPL042C 1668 nt9.32□□□□□ -0.92
LDB18Q07887 VRG4YGL225W 1014 nt9.32□□□□□ -0.92
LDB18Q07887 PET8YNL003C 855 nt9.32□□□□□ -0.92
LDB18Q07887 SEC61YLR378C 1443 nt9.31□□□□□ -0.92
LDB18Q07887 YJL067WYJL067W 351 nt9.31□□□□□ -0.92
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