Protein–RNA interactions for Protein: Q06625

GDB1, Glycogen debranching enzyme, yeastyeast

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Length 1,536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDB1Q06625 UTH1YKR042W 1098 nt14.9□□□□□ -0.02
GDB1Q06625 TSC10YBR265W 963 nt14.89□□□□□ -0.03
GDB1Q06625 YFL054CYFL054C 1941 nt14.88□□□□□ -0.03
GDB1Q06625 CCA1YER168C 1641 nt14.88□□□□□ -0.03
GDB1Q06625 TOM6YOR045W 186 nt14.87□□□□□ -0.03
GDB1Q06625 YJL195CYJL195C 702 nt14.85□□□□□ -0.03
GDB1Q06625 MSB4YOL112W 1479 nt14.82□□□□□ -0.04
GDB1Q06625 NRT1YOR071C 1797 nt14.82□□□□□ -0.04
GDB1Q06625 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt14.82□□□□□ -0.04
GDB1Q06625 TIR3YIL011W 810 nt14.78□□□□□ -0.04
GDB1Q06625 ADH1YOL086C 1047 nt14.76□□□□□ -0.05
GDB1Q06625 HIP1YGR191W 1812 nt14.76□□□□□ -0.05
GDB1Q06625 RIB3YDR487C 627 nt14.72□□□□□ -0.05
GDB1Q06625 CPD1YGR247W 720 nt14.69□□□□□ -0.06
GDB1Q06625 LOT5YKL183W 921 nt14.69□□□□□ -0.06
GDB1Q06625 AAC1YMR056C 930 nt14.68□□□□□ -0.06
GDB1Q06625 AQY2YLL052C 450 nt14.67□□□□□ -0.06
GDB1Q06625 NBP35YGL091C 987 nt14.66□□□□□ -0.06
GDB1Q06625 ESS1YJR017C 513 nt14.66□□□□□ -0.06
GDB1Q06625 SWE1YJL187C 2460 nt14.64□□□□□ -0.07
GDB1Q06625 ATG15YCR068W 1563 nt14.63□□□□□ -0.07
GDB1Q06625 TIF6YPR016C 738 nt14.61□□□□□ -0.07
GDB1Q06625 YEL008WYEL008W 381 nt14.6□□□□□ -0.07
GDB1Q06625 POM34YLR018C 900 nt14.6□□□□□ -0.07
GDB1Q06625 DUS1YML080W 1272 nt14.6□□□□□ -0.07
GDB1Q06625 YPI1YFR003C 468 nt14.59□□□□□ -0.07
GDB1Q06625 RDN18-1RDN18-1 1800 nt14.58□□□□□ -0.08
GDB1Q06625 RDN18-2RDN18-2 1800 nt14.58□□□□□ -0.08
GDB1Q06625 PRO1YDR300C 1287 nt14.57□□□□□ -0.08
GDB1Q06625 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt14.56□□□□□ -0.08
GDB1Q06625 SEN2YLR105C 1134 nt14.56□□□□□ -0.08
GDB1Q06625 MET28YIR017C 564 nt14.53□□□□□ -0.08
GDB1Q06625 PUP1YOR157C 786 nt14.51□□□□□ -0.09
GDB1Q06625 ZTA1YBR046C 1005 nt14.51□□□□□ -0.09
GDB1Q06625 YML089CYML089C 369 nt14.49□□□□□ -0.09
GDB1Q06625 APT2YDR441C 546 nt14.48□□□□□ -0.09
GDB1Q06625 GND1YHR183W 1470 nt14.48□□□□□ -0.09
GDB1Q06625 STR3YGL184C 1398 nt14.44□□□□□ -0.1
GDB1Q06625 NAP1YKR048C 1254 nt14.44□□□□□ -0.1
GDB1Q06625 AKR2YOR034C 2250 nt14.41□□□□□ -0.1
GDB1Q06625 FIT3YOR383C 615 nt14.41□□□□□ -0.1
GDB1Q06625 RIB2YOL066C 1776 nt14.4□□□□□ -0.1
GDB1Q06625 LSB3YFR024C-A 1380 nt14.37□□□□□ -0.11
GDB1Q06625 LSC2YGR244C 1284 nt14.37□□□□□ -0.11
GDB1Q06625 PGC1YPL206C 966 nt14.36□□□□□ -0.11
GDB1Q06625 PAU5YFL020C 369 nt14.34□□□□□ -0.11
GDB1Q06625 YCL074WYCL074W 927 nt14.31□□□□□ -0.12
GDB1Q06625 SMM1YNR015W 1155 nt14.31□□□□□ -0.12
GDB1Q06625 YJR114WYJR114W 393 nt14.25□□□□□ -0.13
GDB1Q06625 PRY1YJL079C 900 nt14.25□□□□□ -0.13
GDB1Q06625 GAP1YKR039W 1809 nt14.23□□□□□ -0.13
GDB1Q06625 YJL055WYJL055W 738 nt14.23□□□□□ -0.13
GDB1Q06625 YAR028WYAR028W 705 nt14.22□□□□□ -0.13
GDB1Q06625 ALD4YOR374W 1560 nt14.21□□□□□ -0.14
GDB1Q06625 YBR232CYBR232C 360 nt14.2□□□□□ -0.14
GDB1Q06625 ARP6YLR085C 1317 nt14.2□□□□□ -0.14
GDB1Q06625 YJL064WYJL064W 396 nt14.2□□□□□ -0.14
GDB1Q06625 DIF1YLR437C 402 nt14.2□□□□□ -0.14
GDB1Q06625 UGA4YDL210W 1716 nt14.18□□□□□ -0.14
GDB1Q06625 PLB1YMR008C 1995 nt14.17□□□□□ -0.14
GDB1Q06625 PAU19YMR325W 375 nt14.16□□□□□ -0.14
GDB1Q06625 SLG1YOR008C 1137 nt14.15□□□□□ -0.14
GDB1Q06625 RTN2YDL204W 1182 nt14.14□□□□□ -0.15
GDB1Q06625 FUR4YBR021W 1902 nt14.09□□□□□ -0.15
GDB1Q06625 FCY21YER060W 1587 nt14.09□□□□□ -0.15
GDB1Q06625 VRG4YGL225W 1014 nt14.09□□□□□ -0.15
GDB1Q06625 MTG2YHR168W 1557 nt14.08□□□□□ -0.15
GDB1Q06625 ALP1YNL270C 1722 nt14.08□□□□□ -0.16
GDB1Q06625 HXT12YIL170W 1374 nt14.06□□□□□ -0.16
GDB1Q06625 THI72YOR192C 1800 nt14.03□□□□□ -0.16
GDB1Q06625 TIM44YIL022W 1296 nt14.03□□□□□ -0.16
GDB1Q06625 TIP1YBR067C 633 nt14.03□□□□□ -0.16
GDB1Q06625 UTR1YJR049C 1593 nt14.02□□□□□ -0.16
GDB1Q06625 HSP60YLR259C 1719 nt13.97□□□□□ -0.17
GDB1Q06625 STP3YLR375W 1032 nt13.96□□□□□ -0.17
GDB1Q06625 CCT5YJR064W 1689 nt13.96□□□□□ -0.18
GDB1Q06625 SED1YDR077W 1017 nt13.93□□□□□ -0.18
GDB1Q06625 YER190C-AYER190C-A 576 nt13.9□□□□□ -0.18
GDB1Q06625 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt13.9□□□□□ -0.18
GDB1Q06625 ERG6YML008C 1152 nt13.9□□□□□ -0.18
GDB1Q06625 YML133W-AYML133W-A 576 nt13.9□□□□□ -0.18
GDB1Q06625 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt13.9□□□□□ -0.18
GDB1Q06625 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt13.9□□□□□ -0.18
GDB1Q06625 MEP3YPR138C 1470 nt13.88□□□□□ -0.19
GDB1Q06625 YJL118WYJL118W 660 nt13.87□□□□□ -0.19
GDB1Q06625 PRM5YIL117C 957 nt13.86□□□□□ -0.19
GDB1Q06625 RIB1YBL033C 1038 nt13.86□□□□□ -0.19
GDB1Q06625 YPL251WYPL251W 303 nt13.84□□□□□ -0.19
GDB1Q06625 YKR005CYKR005C 1578 nt13.83□□□□□ -0.19
GDB1Q06625 YGR259CYGR259C 441 nt13.82□□□□□ -0.2
GDB1Q06625 SOD2YHR008C 702 nt13.8□□□□□ -0.2
GDB1Q06625 TAF13YML098W 504 nt13.8□□□□□ -0.2
GDB1Q06625 YMR262WYMR262W 942 nt13.8□□□□□ -0.2
GDB1Q06625 PAC11YDR488C 1602 nt13.8□□□□□ -0.2
GDB1Q06625 SNZ1YMR096W 894 nt13.8□□□□□ -0.2
GDB1Q06625 GAL3YDR009W 1563 nt13.78□□□□□ -0.2
GDB1Q06625 LSB5YCL034W 1065 nt13.76□□□□□ -0.21
GDB1Q06625 LIP1YMR298W 453 nt13.73□□□□□ -0.21
GDB1Q06625 CSM1YCR086W 573 nt13.72□□□□□ -0.21
GDB1Q06625 SAM35YHR083W 990 nt13.71□□□□□ -0.21
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