Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	CAB5	YDR196C	726 nt		12.03	□□□□□ -0.48
SYF1	Q04048	PEX2	YJL210W	816 nt		12.02	□□□□□ -0.49
SYF1	Q04048	YGR012W	YGR012W	1182 nt		12.01	□□□□□ -0.49
SYF1	Q04048	TSC10	YBR265W	963 nt		12.01	□□□□□ -0.49
SYF1	Q04048	RIB3	YDR487C	627 nt		11.99	□□□□□ -0.49
SYF1	Q04048	HIP1	YGR191W	1812 nt		11.98	□□□□□ -0.49
SYF1	Q04048	NRT1	YOR071C	1797 nt		11.98	□□□□□ -0.49
SYF1	Q04048	YLR349W	YLR349W	507 nt		11.97	□□□□□ -0.49
SYF1	Q04048	POM34	YLR018C	900 nt		11.95	□□□□□ -0.5
SYF1	Q04048	FUN14	YAL008W	597 nt		11.94	□□□□□ -0.5
SYF1	Q04048	ADH7	YCR105W	1086 nt		11.93	□□□□□ -0.5
SYF1	Q04048	YJL195C	YJL195C	702 nt		11.93	□□□□□ -0.5
SYF1	Q04048	PAU15	YIR041W	375 nt		11.92	□□□□□ -0.5
SYF1	Q04048	DUS1	YML080W	1272 nt		11.92	□□□□□ -0.5
SYF1	Q04048	AQY2	YLL052C	450 nt		11.91	□□□□□ -0.5
SYF1	Q04048	YLR279W	YLR279W	390 nt		11.91	□□□□□ -0.5
SYF1	Q04048	PRO1	YDR300C	1287 nt		11.9	□□□□□ -0.5
SYF1	Q04048	YML089C	YML089C	369 nt		11.9	□□□□□ -0.5
SYF1	Q04048	MET28	YIR017C	564 nt		11.89	□□□□□ -0.51
SYF1	Q04048	TIF6	YPR016C	738 nt		11.86	□□□□□ -0.51
SYF1	Q04048	STR3	YGL184C	1398 nt		11.86	□□□□□ -0.51
SYF1	Q04048	SWE1	YJL187C	2460 nt		11.86	□□□□□ -0.51
SYF1	Q04048	LSC2	YGR244C	1284 nt		11.85	□□□□□ -0.51
SYF1	Q04048	ATG15	YCR068W	1563 nt		11.84	□□□□□ -0.51
SYF1	Q04048	ADH1	YOL086C	1047 nt		11.84	□□□□□ -0.51
SYF1	Q04048	YPL222C-A	YPL222C-A	246 nt		11.84	□□□□□ -0.51
SYF1	Q04048	MSB4	YOL112W	1479 nt		11.82	□□□□□ -0.52
SYF1	Q04048	GPN2	YOR262W	1044 nt		11.8	□□□□□ -0.52
SYF1	Q04048	RDN18-1	RDN18-1	1800 nt		11.78	□□□□□ -0.52
SYF1	Q04048	RDN18-2	RDN18-2	1800 nt		11.78	□□□□□ -0.52
SYF1	Q04048	YPI1	YFR003C	468 nt		11.76	□□□□□ -0.53
SYF1	Q04048	FIT3	YOR383C	615 nt		11.75	□□□□□ -0.53
SYF1	Q04048	YCL074W	YCL074W	927 nt		11.72	□□□□□ -0.53
SYF1	Q04048	YEL008W	YEL008W	381 nt		11.72	□□□□□ -0.53
SYF1	Q04048	LOT5	YKL183W	921 nt		11.7	□□□□□ -0.54
SYF1	Q04048	GND1	YHR183W	1470 nt		11.7	□□□□□ -0.54
SYF1	Q04048	CPD1	YGR247W	720 nt		11.69	□□□□□ -0.54
SYF1	Q04048	AAC1	YMR056C	930 nt		11.69	□□□□□ -0.54
SYF1	Q04048	GAP1	YKR039W	1809 nt		11.67	□□□□□ -0.54
SYF1	Q04048	ARP6	YLR085C	1317 nt		11.67	□□□□□ -0.54
SYF1	Q04048	tS(GCU)L	tS(GCU)L	80 nt		11.67	□□□□□ -0.54
SYF1	Q04048	ESS1	YJR017C	513 nt		11.65	□□□□□ -0.54
SYF1	Q04048	APT2	YDR441C	546 nt		11.64	□□□□□ -0.55
SYF1	Q04048	UME6	YDR207C	2511 nt		11.59	□□□□□ -0.55
SYF1	Q04048	SMM1	YNR015W	1155 nt		11.57	□□□□□ -0.56
SYF1	Q04048	ALP1	YNL270C	1722 nt		11.56	□□□□□ -0.56
SYF1	Q04048	PLB1	YMR008C	1995 nt		11.56	□□□□□ -0.56
SYF1	Q04048	ZTA1	YBR046C	1005 nt		11.55	□□□□□ -0.56
SYF1	Q04048	YAR028W	YAR028W	705 nt		11.53	□□□□□ -0.56
SYF1	Q04048	AKR2	YOR034C	2250 nt		11.52	□□□□□ -0.57
SYF1	Q04048	RTN2	YDL204W	1182 nt		11.51	□□□□□ -0.57
SYF1	Q04048	DIF1	YLR437C	402 nt		11.51	□□□□□ -0.57
SYF1	Q04048	RIB2	YOL066C	1776 nt		11.51	□□□□□ -0.57
SYF1	Q04048	LSB3	YFR024C-A	1380 nt		11.5	□□□□□ -0.57
SYF1	Q04048	MTG2	YHR168W	1557 nt		11.49	□□□□□ -0.57
SYF1	Q04048	SEN2	YLR105C	1134 nt		11.48	□□□□□ -0.57
SYF1	Q04048	FCY21	YER060W	1587 nt		11.45	□□□□□ -0.58
SYF1	Q04048	NAP1	YKR048C	1254 nt		11.44	□□□□□ -0.58
SYF1	Q04048	FUR4	YBR021W	1902 nt		11.43	□□□□□ -0.58
SYF1	Q04048	UTR1	YJR049C	1593 nt		11.41	□□□□□ -0.58
SYF1	Q04048	PUP1	YOR157C	786 nt		11.41	□□□□□ -0.58
SYF1	Q04048	VRG4	YGL225W	1014 nt		11.38	□□□□□ -0.59
SYF1	Q04048	PAU5	YFL020C	369 nt		11.37	□□□□□ -0.59
SYF1	Q04048	PRY1	YJL079C	900 nt		11.37	□□□□□ -0.59
SYF1	Q04048	HXT12	YIL170W	1374 nt		11.36	□□□□□ -0.59
SYF1	Q04048	PGC1	YPL206C	966 nt		11.35	□□□□□ -0.59
SYF1	Q04048	ALD4	YOR374W	1560 nt		11.33	□□□□□ -0.6
SYF1	Q04048	UGA4	YDL210W	1716 nt		11.32	□□□□□ -0.6
SYF1	Q04048	YER190C-A	YER190C-A	576 nt		11.31	□□□□□ -0.6
SYF1	Q04048	YGR296C-A	YGR296C-A	576 nt		11.31	□□□□□ -0.6
SYF1	Q04048	YJL055W	YJL055W	738 nt		11.31	□□□□□ -0.6
SYF1	Q04048	YML133W-A	YML133W-A	576 nt		11.31	□□□□□ -0.6
SYF1	Q04048	YNL339W-A	YNL339W-A	576 nt		11.31	□□□□□ -0.6
SYF1	Q04048	YPL283W-A	YPL283W-A	576 nt		11.31	□□□□□ -0.6
SYF1	Q04048	YGR259C	YGR259C	441 nt		11.3	□□□□□ -0.6
SYF1	Q04048	YBR232C	YBR232C	360 nt		11.3	□□□□□ -0.6
SYF1	Q04048	STP3	YLR375W	1032 nt		11.28	□□□□□ -0.6
SYF1	Q04048	SED1	YDR077W	1017 nt		11.27	□□□□□ -0.61
SYF1	Q04048	YKR005C	YKR005C	1578 nt		11.26	□□□□□ -0.61
SYF1	Q04048	SAM35	YHR083W	990 nt		11.26	□□□□□ -0.61
SYF1	Q04048	YJL064W	YJL064W	396 nt		11.26	□□□□□ -0.61
SYF1	Q04048	CCT5	YJR064W	1689 nt		11.24	□□□□□ -0.61
SYF1	Q04048	LIP1	YMR298W	453 nt		11.2	□□□□□ -0.62
SYF1	Q04048	PRM5	YIL117C	957 nt		11.19	□□□□□ -0.62
SYF1	Q04048	PAU19	YMR325W	375 nt		11.18	□□□□□ -0.62
SYF1	Q04048	TAF13	YML098W	504 nt		11.15	□□□□□ -0.62
SYF1	Q04048	SLG1	YOR008C	1137 nt		11.14	□□□□□ -0.63
SYF1	Q04048	HSP60	YLR259C	1719 nt		11.14	□□□□□ -0.63
SYF1	Q04048	THI72	YOR192C	1800 nt		11.14	□□□□□ -0.63
SYF1	Q04048	CSM1	YCR086W	573 nt		11.13	□□□□□ -0.63
SYF1	Q04048	YPL251W	YPL251W	303 nt		11.13	□□□□□ -0.63
SYF1	Q04048	MEP3	YPR138C	1470 nt		11.12	□□□□□ -0.63
SYF1	Q04048	TIM44	YIL022W	1296 nt		11.12	□□□□□ -0.63
SYF1	Q04048	YMR103C	YMR103C	363 nt		11.12	□□□□□ -0.63
SYF1	Q04048	LSB5	YCL034W	1065 nt		11.12	□□□□□ -0.63
SYF1	Q04048	YJL225C	YJL225C	5277 nt		11.11	□□□□□ -0.63
SYF1	Q04048	PRP4	YPR178W	1398 nt		11.11	□□□□□ -0.63
SYF1	Q04048	BRR1	YPR057W	1026 nt		11.1	□□□□□ -0.63
SYF1	Q04048	YJL118W	YJL118W	660 nt		11.08	□□□□□ -0.64
SYF1	Q04048	TOA2	YKL058W	369 nt		11.08	□□□□□ -0.64

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.4 ms