Protein–RNA interactions for Protein: P53599

SSK2, MAP kinase kinase kinase SSK2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK2P53599 FUN14YAL008W 597 nt16.55■□□□□ 0.24
SSK2P53599 UTH1YKR042W 1098 nt16.55■□□□□ 0.24
SSK2P53599 YFL054CYFL054C 1941 nt16.54■□□□□ 0.24
SSK2P53599 PTK1YKL198C 1989 nt16.52■□□□□ 0.24
SSK2P53599 CLB6YGR109C 1143 nt16.52■□□□□ 0.24
SSK2P53599 TSC10YBR265W 963 nt16.52■□□□□ 0.24
SSK2P53599 MSB4YOL112W 1479 nt16.5■□□□□ 0.23
SSK2P53599 NRT1YOR071C 1797 nt16.48■□□□□ 0.23
SSK2P53599 TIR3YIL011W 810 nt16.47■□□□□ 0.23
SSK2P53599 YJL195CYJL195C 702 nt16.44■□□□□ 0.22
SSK2P53599 AQY2YLL052C 450 nt16.44■□□□□ 0.22
SSK2P53599 HIP1YGR191W 1812 nt16.43■□□□□ 0.22
SSK2P53599 DUS1YML080W 1272 nt16.36■□□□□ 0.21
SSK2P53599 NBP35YGL091C 987 nt16.35■□□□□ 0.21
SSK2P53599 CPD1YGR247W 720 nt16.34■□□□□ 0.21
SSK2P53599 ADH1YOL086C 1047 nt16.34■□□□□ 0.21
SSK2P53599 ATG15YCR068W 1563 nt16.32■□□□□ 0.2
SSK2P53599 ESS1YJR017C 513 nt16.32■□□□□ 0.2
SSK2P53599 LOT5YKL183W 921 nt16.31■□□□□ 0.2
SSK2P53599 AAC1YMR056C 930 nt16.31■□□□□ 0.2
SSK2P53599 RIB3YDR487C 627 nt16.3■□□□□ 0.2
SSK2P53599 SEN2YLR105C 1134 nt16.27■□□□□ 0.2
SSK2P53599 TIF6YPR016C 738 nt16.27■□□□□ 0.2
SSK2P53599 PRO1YDR300C 1287 nt16.26■□□□□ 0.19
SSK2P53599 POM34YLR018C 900 nt16.26■□□□□ 0.19
SSK2P53599 SWE1YJL187C 2460 nt16.26■□□□□ 0.19
SSK2P53599 RDN18-1RDN18-1 1800 nt16.25■□□□□ 0.19
SSK2P53599 RDN18-2RDN18-2 1800 nt16.25■□□□□ 0.19
SSK2P53599 PUP1YOR157C 786 nt16.22■□□□□ 0.19
SSK2P53599 ZTA1YBR046C 1005 nt16.21■□□□□ 0.19
SSK2P53599 YEL008WYEL008W 381 nt16.17■□□□□ 0.18
SSK2P53599 YPI1YFR003C 468 nt16.15■□□□□ 0.18
SSK2P53599 NAP1YKR048C 1254 nt16.15■□□□□ 0.18
SSK2P53599 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt16.15■□□□□ 0.18
SSK2P53599 MET28YIR017C 564 nt16.14■□□□□ 0.17
SSK2P53599 YML089CYML089C 369 nt16.12■□□□□ 0.17
SSK2P53599 AKR2YOR034C 2250 nt16.09■□□□□ 0.17
SSK2P53599 APT2YDR441C 546 nt16.09■□□□□ 0.17
SSK2P53599 GND1YHR183W 1470 nt16.06■□□□□ 0.16
SSK2P53599 STR3YGL184C 1398 nt16.06■□□□□ 0.16
SSK2P53599 RIB2YOL066C 1776 nt16.01■□□□□ 0.15
SSK2P53599 LSC2YGR244C 1284 nt16■□□□□ 0.15
SSK2P53599 FIT3YOR383C 615 nt16■□□□□ 0.15
SSK2P53599 YCL074WYCL074W 927 nt15.99■□□□□ 0.15
SSK2P53599 YJR114WYJR114W 393 nt15.98■□□□□ 0.15
SSK2P53599 LSB3YFR024C-A 1380 nt15.97■□□□□ 0.15
SSK2P53599 PAU5YFL020C 369 nt15.92■□□□□ 0.14
SSK2P53599 PGC1YPL206C 966 nt15.91■□□□□ 0.14
SSK2P53599 GAP1YKR039W 1809 nt15.9■□□□□ 0.14
SSK2P53599 SMM1YNR015W 1155 nt15.89■□□□□ 0.13
SSK2P53599 YJL055WYJL055W 738 nt15.87■□□□□ 0.13
SSK2P53599 PRY1YJL079C 900 nt15.87■□□□□ 0.13
SSK2P53599 YAR028WYAR028W 705 nt15.86■□□□□ 0.13
SSK2P53599 DIF1YLR437C 402 nt15.86■□□□□ 0.13
SSK2P53599 ARP6YLR085C 1317 nt15.85■□□□□ 0.13
SSK2P53599 RTN2YDL204W 1182 nt15.84■□□□□ 0.13
SSK2P53599 UGA4YDL210W 1716 nt15.84■□□□□ 0.13
SSK2P53599 PLB1YMR008C 1995 nt15.82■□□□□ 0.12
SSK2P53599 YJL064WYJL064W 396 nt15.8■□□□□ 0.12
SSK2P53599 SLG1YOR008C 1137 nt15.8■□□□□ 0.12
SSK2P53599 ALD4YOR374W 1560 nt15.77■□□□□ 0.11
SSK2P53599 PAU19YMR325W 375 nt15.76■□□□□ 0.11
SSK2P53599 YBR232CYBR232C 360 nt15.75■□□□□ 0.11
SSK2P53599 MTG2YHR168W 1557 nt15.71■□□□□ 0.11
SSK2P53599 UTR1YJR049C 1593 nt15.69■□□□□ 0.1
SSK2P53599 TIM44YIL022W 1296 nt15.68■□□□□ 0.1
SSK2P53599 FCY21YER060W 1587 nt15.68■□□□□ 0.1
SSK2P53599 ALP1YNL270C 1722 nt15.66■□□□□ 0.1
SSK2P53599 VRG4YGL225W 1014 nt15.66■□□□□ 0.1
SSK2P53599 TIP1YBR067C 633 nt15.66■□□□□ 0.1
SSK2P53599 FUR4YBR021W 1902 nt15.64■□□□□ 0.09
SSK2P53599 HXT12YIL170W 1374 nt15.63■□□□□ 0.09
SSK2P53599 THI72YOR192C 1800 nt15.58■□□□□ 0.08
SSK2P53599 ERG6YML008C 1152 nt15.58■□□□□ 0.08
SSK2P53599 SED1YDR077W 1017 nt15.56■□□□□ 0.08
SSK2P53599 HSP60YLR259C 1719 nt15.55■□□□□ 0.08
SSK2P53599 YER190C-AYER190C-A 576 nt15.54■□□□□ 0.08
SSK2P53599 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt15.54■□□□□ 0.08
SSK2P53599 YML133W-AYML133W-A 576 nt15.54■□□□□ 0.08
SSK2P53599 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt15.54■□□□□ 0.08
SSK2P53599 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt15.54■□□□□ 0.08
SSK2P53599 PRM5YIL117C 957 nt15.53■□□□□ 0.08
SSK2P53599 MEP3YPR138C 1470 nt15.52■□□□□ 0.08
SSK2P53599 CCT5YJR064W 1689 nt15.49■□□□□ 0.07
SSK2P53599 YJL118WYJL118W 660 nt15.47■□□□□ 0.07
SSK2P53599 YPL251WYPL251W 303 nt15.47■□□□□ 0.07
SSK2P53599 STP3YLR375W 1032 nt15.46■□□□□ 0.07
SSK2P53599 RIB1YBL033C 1038 nt15.46■□□□□ 0.07
SSK2P53599 YGR259CYGR259C 441 nt15.41■□□□□ 0.06
SSK2P53599 SOD2YHR008C 702 nt15.41■□□□□ 0.06
SSK2P53599 YKR005CYKR005C 1578 nt15.4■□□□□ 0.06
SSK2P53599 SNZ1YMR096W 894 nt15.36■□□□□ 0.05
SSK2P53599 GAL3YDR009W 1563 nt15.34■□□□□ 0.05
SSK2P53599 LIP1YMR298W 453 nt15.33■□□□□ 0.05
SSK2P53599 LSB5YCL034W 1065 nt15.33■□□□□ 0.05
SSK2P53599 SAM35YHR083W 990 nt15.32■□□□□ 0.04
SSK2P53599 POP2YNR052C 1302 nt15.31■□□□□ 0.04
SSK2P53599 QDR2YIL121W 1629 nt15.3■□□□□ 0.04
SSK2P53599 YMR262WYMR262W 942 nt15.3■□□□□ 0.04
SSK2P53599 YBL086CYBL086C 1401 nt15.29■□□□□ 0.04
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