Protein–RNA interactions for Protein: P53127

SNT2, E3 ubiquitin-protein ligase SNT2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNT2P53127 CCA1YER168C 1641 nt15.24■□□□□ 0.03
SNT2P53127 FUN14YAL008W 597 nt15.24■□□□□ 0.03
SNT2P53127 YJL195CYJL195C 702 nt15.24■□□□□ 0.03
SNT2P53127 CLB6YGR109C 1143 nt15.22■□□□□ 0.03
SNT2P53127 UTH1YKR042W 1098 nt15.18■□□□□ 0.02
SNT2P53127 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt15.15■□□□□ 0.02
SNT2P53127 TSC10YBR265W 963 nt15.13■□□□□ 0.01
SNT2P53127 AQY2YLL052C 450 nt15.12■□□□□ 0.01
SNT2P53127 NRT1YOR071C 1797 nt15.12■□□□□ 0.01
SNT2P53127 DUS1YML080W 1272 nt15.11■□□□□ 0.01
SNT2P53127 TIR3YIL011W 810 nt15.1■□□□□ 0.01
SNT2P53127 HIP1YGR191W 1812 nt15.09■□□□□ 0.01
SNT2P53127 NBP35YGL091C 987 nt15.09■□□□□ 0.01
SNT2P53127 RIB3YDR487C 627 nt15.07■□□□□ 0
SNT2P53127 MSB4YOL112W 1479 nt15.07■□□□□ 0
SNT2P53127 ADH1YOL086C 1047 nt15.05■□□□□ -0
SNT2P53127 PRO1YDR300C 1287 nt15.02■□□□□ -0
SNT2P53127 CPD1YGR247W 720 nt15.01□□□□□ -0.01
SNT2P53127 ESS1YJR017C 513 nt15□□□□□ -0.01
SNT2P53127 POM34YLR018C 900 nt15□□□□□ -0.01
SNT2P53127 ATG15YCR068W 1563 nt14.99□□□□□ -0.01
SNT2P53127 AAC1YMR056C 930 nt14.96□□□□□ -0.01
SNT2P53127 TIF6YPR016C 738 nt14.93□□□□□ -0.02
SNT2P53127 SWE1YJL187C 2460 nt14.92□□□□□ -0.02
SNT2P53127 YEL008WYEL008W 381 nt14.92□□□□□ -0.02
SNT2P53127 LOT5YKL183W 921 nt14.92□□□□□ -0.02
SNT2P53127 RDN18-1RDN18-1 1800 nt14.91□□□□□ -0.02
SNT2P53127 RDN18-2RDN18-2 1800 nt14.91□□□□□ -0.02
SNT2P53127 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt14.88□□□□□ -0.03
SNT2P53127 YPI1YFR003C 468 nt14.87□□□□□ -0.03
SNT2P53127 MET28YIR017C 564 nt14.87□□□□□ -0.03
SNT2P53127 SEN2YLR105C 1134 nt14.86□□□□□ -0.03
SNT2P53127 STR3YGL184C 1398 nt14.85□□□□□ -0.03
SNT2P53127 YML089CYML089C 369 nt14.83□□□□□ -0.04
SNT2P53127 PUP1YOR157C 786 nt14.82□□□□□ -0.04
SNT2P53127 APT2YDR441C 546 nt14.81□□□□□ -0.04
SNT2P53127 ZTA1YBR046C 1005 nt14.79□□□□□ -0.04
SNT2P53127 NAP1YKR048C 1254 nt14.75□□□□□ -0.05
SNT2P53127 GND1YHR183W 1470 nt14.74□□□□□ -0.05
SNT2P53127 LSC2YGR244C 1284 nt14.72□□□□□ -0.05
SNT2P53127 YCL074WYCL074W 927 nt14.69□□□□□ -0.06
SNT2P53127 AKR2YOR034C 2250 nt14.69□□□□□ -0.06
SNT2P53127 RIB2YOL066C 1776 nt14.69□□□□□ -0.06
SNT2P53127 FIT3YOR383C 615 nt14.68□□□□□ -0.06
SNT2P53127 PAU5YFL020C 369 nt14.66□□□□□ -0.06
SNT2P53127 GAP1YKR039W 1809 nt14.65□□□□□ -0.06
SNT2P53127 SMM1YNR015W 1155 nt14.64□□□□□ -0.07
SNT2P53127 LSB3YFR024C-A 1380 nt14.6□□□□□ -0.07
SNT2P53127 PGC1YPL206C 966 nt14.6□□□□□ -0.07
SNT2P53127 PLB1YMR008C 1995 nt14.56□□□□□ -0.08
SNT2P53127 ARP6YLR085C 1317 nt14.56□□□□□ -0.08
SNT2P53127 YJL064WYJL064W 396 nt14.52□□□□□ -0.08
SNT2P53127 YJR114WYJR114W 393 nt14.52□□□□□ -0.08
SNT2P53127 YAR028WYAR028W 705 nt14.52□□□□□ -0.08
SNT2P53127 YJL055WYJL055W 738 nt14.51□□□□□ -0.09
SNT2P53127 DIF1YLR437C 402 nt14.5□□□□□ -0.09
SNT2P53127 PRY1YJL079C 900 nt14.49□□□□□ -0.09
SNT2P53127 RTN2YDL204W 1182 nt14.47□□□□□ -0.09
SNT2P53127 SLG1YOR008C 1137 nt14.47□□□□□ -0.09
SNT2P53127 MTG2YHR168W 1557 nt14.46□□□□□ -0.09
SNT2P53127 YBR232CYBR232C 360 nt14.46□□□□□ -0.09
SNT2P53127 UGA4YDL210W 1716 nt14.46□□□□□ -0.1
SNT2P53127 ALP1YNL270C 1722 nt14.44□□□□□ -0.1
SNT2P53127 PAU19YMR325W 375 nt14.43□□□□□ -0.1
SNT2P53127 ALD4YOR374W 1560 nt14.42□□□□□ -0.1
SNT2P53127 VRG4YGL225W 1014 nt14.41□□□□□ -0.1
SNT2P53127 UTR1YJR049C 1593 nt14.41□□□□□ -0.1
SNT2P53127 FUR4YBR021W 1902 nt14.39□□□□□ -0.11
SNT2P53127 YER190C-AYER190C-A 576 nt14.36□□□□□ -0.11
SNT2P53127 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt14.36□□□□□ -0.11
SNT2P53127 YML133W-AYML133W-A 576 nt14.36□□□□□ -0.11
SNT2P53127 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt14.36□□□□□ -0.11
SNT2P53127 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt14.36□□□□□ -0.11
SNT2P53127 FCY21YER060W 1587 nt14.36□□□□□ -0.11
SNT2P53127 TIM44YIL022W 1296 nt14.34□□□□□ -0.11
SNT2P53127 STP3YLR375W 1032 nt14.32□□□□□ -0.12
SNT2P53127 TIP1YBR067C 633 nt14.3□□□□□ -0.12
SNT2P53127 HXT12YIL170W 1374 nt14.28□□□□□ -0.12
SNT2P53127 ERG6YML008C 1152 nt14.25□□□□□ -0.13
SNT2P53127 SED1YDR077W 1017 nt14.23□□□□□ -0.13
SNT2P53127 PRM5YIL117C 957 nt14.22□□□□□ -0.13
SNT2P53127 THI72YOR192C 1800 nt14.21□□□□□ -0.13
SNT2P53127 HSP60YLR259C 1719 nt14.21□□□□□ -0.13
SNT2P53127 RIB1YBL033C 1038 nt14.19□□□□□ -0.14
SNT2P53127 MEP3YPR138C 1470 nt14.18□□□□□ -0.14
SNT2P53127 SOD2YHR008C 702 nt14.18□□□□□ -0.14
SNT2P53127 YGR259CYGR259C 441 nt14.17□□□□□ -0.14
SNT2P53127 YPL251WYPL251W 303 nt14.17□□□□□ -0.14
SNT2P53127 CCT5YJR064W 1689 nt14.17□□□□□ -0.14
SNT2P53127 YKR005CYKR005C 1578 nt14.15□□□□□ -0.14
SNT2P53127 YMR103CYMR103C 363 nt14.11□□□□□ -0.15
SNT2P53127 LIP1YMR298W 453 nt14.11□□□□□ -0.15
SNT2P53127 YJL118WYJL118W 660 nt14.08□□□□□ -0.15
SNT2P53127 TAF13YML098W 504 nt14.08□□□□□ -0.15
SNT2P53127 SNZ1YMR096W 894 nt14.07□□□□□ -0.16
SNT2P53127 YMR262WYMR262W 942 nt14.07□□□□□ -0.16
SNT2P53127 CSM1YCR086W 573 nt14.06□□□□□ -0.16
SNT2P53127 SAM35YHR083W 990 nt14.06□□□□□ -0.16
SNT2P53127 GAL3YDR009W 1563 nt14.04□□□□□ -0.16
SNT2P53127 LSB5YCL034W 1065 nt14.03□□□□□ -0.16
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