Protein–RNA interactions for Protein: P49573

CTR1, Copper transport protein CTR1, yeastyeast

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTR1P49573 DUS1YML080W 1272 nt11.04□□□□□ -0.64
CTR1P49573 PRO1YDR300C 1287 nt11.03□□□□□ -0.64
CTR1P49573 AQY2YLL052C 450 nt11.03□□□□□ -0.64
CTR1P49573 YLR111WYLR111W 333 nt11.03□□□□□ -0.64
CTR1P49573 SDH5YOL071W 489 nt11□□□□□ -0.65
CTR1P49573 TIF6YPR016C 738 nt10.97□□□□□ -0.65
CTR1P49573 YGR012WYGR012W 1182 nt10.96□□□□□ -0.65
CTR1P49573 UTH1YKR042W 1098 nt10.96□□□□□ -0.65
CTR1P49573 BOR1YNL275W 1731 nt10.95□□□□□ -0.66
CTR1P49573 RAD23YEL037C 1197 nt10.95□□□□□ -0.66
CTR1P49573 CLB6YGR109C 1143 nt10.95□□□□□ -0.66
CTR1P49573 HSP60YLR259C 1719 nt10.93□□□□□ -0.66
CTR1P49573 YCL074WYCL074W 927 nt10.93□□□□□ -0.66
CTR1P49573 YLR279WYLR279W 390 nt10.93□□□□□ -0.66
CTR1P49573 NRT1YOR071C 1797 nt10.93□□□□□ -0.66
CTR1P49573 FUR4YBR021W 1902 nt10.92□□□□□ -0.66
CTR1P49573 MSB4YOL112W 1479 nt10.91□□□□□ -0.66
CTR1P49573 TSC10YBR265W 963 nt10.9□□□□□ -0.66
CTR1P49573 ATG15YCR068W 1563 nt10.9□□□□□ -0.67
CTR1P49573 RIB3YDR487C 627 nt10.89□□□□□ -0.67
CTR1P49573 LSC2YGR244C 1284 nt10.89□□□□□ -0.67
CTR1P49573 ARP6YLR085C 1317 nt10.88□□□□□ -0.67
CTR1P49573 YML089CYML089C 369 nt10.88□□□□□ -0.67
CTR1P49573 YLR349WYLR349W 507 nt10.87□□□□□ -0.67
CTR1P49573 MET28YIR017C 564 nt10.85□□□□□ -0.67
CTR1P49573 PLB1YMR008C 1995 nt10.83□□□□□ -0.68
CTR1P49573 GAP1YKR039W 1809 nt10.82□□□□□ -0.68
CTR1P49573 YNR029CYNR029C 1290 nt10.82□□□□□ -0.68
CTR1P49573 STE4YOR212W 1272 nt10.79□□□□□ -0.68
CTR1P49573 ZTA1YBR046C 1005 nt10.78□□□□□ -0.68
CTR1P49573 ADH1YOL086C 1047 nt10.77□□□□□ -0.69
CTR1P49573 FUN14YAL008W 597 nt10.74□□□□□ -0.69
CTR1P49573 YJL195CYJL195C 702 nt10.73□□□□□ -0.69
CTR1P49573 RTN2YDL204W 1182 nt10.72□□□□□ -0.69
CTR1P49573 DIF1YLR437C 402 nt10.72□□□□□ -0.69
CTR1P49573 PRP4YPR178W 1398 nt10.7□□□□□ -0.7
CTR1P49573 RPM1RPM1 483 nt10.7□□□□□ -0.7
CTR1P49573 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.7□□□□□ -0.7
CTR1P49573 MTG2YHR168W 1557 nt10.69□□□□□ -0.7
CTR1P49573 UTR1YJR049C 1593 nt10.69□□□□□ -0.7
CTR1P49573 FIT3YOR383C 615 nt10.69□□□□□ -0.7
CTR1P49573 AAC1YMR056C 930 nt10.68□□□□□ -0.7
CTR1P49573 LOT5YKL183W 921 nt10.67□□□□□ -0.7
CTR1P49573 GND1YHR183W 1470 nt10.67□□□□□ -0.7
CTR1P49573 YKR005CYKR005C 1578 nt10.65□□□□□ -0.7
CTR1P49573 ADH7YCR105W 1086 nt10.65□□□□□ -0.7
CTR1P49573 DPS1YLL018C 1674 nt10.65□□□□□ -0.7
CTR1P49573 APT2YDR441C 546 nt10.63□□□□□ -0.71
CTR1P49573 PAU15YIR041W 375 nt10.63□□□□□ -0.71
CTR1P49573 YAR028WYAR028W 705 nt10.62□□□□□ -0.71
CTR1P49573 AKR2YOR034C 2250 nt10.61□□□□□ -0.71
CTR1P49573 YPI1YFR003C 468 nt10.61□□□□□ -0.71
CTR1P49573 YGR259CYGR259C 441 nt10.6□□□□□ -0.71
CTR1P49573 SMM1YNR015W 1155 nt10.6□□□□□ -0.71
CTR1P49573 GPN2YOR262W 1044 nt10.6□□□□□ -0.71
CTR1P49573 ALP1YNL270C 1722 nt10.59□□□□□ -0.71
CTR1P49573 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.58□□□□□ -0.72
CTR1P49573 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.58□□□□□ -0.72
CTR1P49573 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.58□□□□□ -0.72
CTR1P49573 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.58□□□□□ -0.72
CTR1P49573 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.58□□□□□ -0.72
CTR1P49573 ALG12YNR030W 1656 nt10.57□□□□□ -0.72
CTR1P49573 FCY21YER060W 1587 nt10.56□□□□□ -0.72
CTR1P49573 UGA4YDL210W 1716 nt10.56□□□□□ -0.72
CTR1P49573 SNF1YDR477W 1902 nt10.55□□□□□ -0.72
CTR1P49573 YEL008WYEL008W 381 nt10.55□□□□□ -0.72
CTR1P49573 PRM5YIL117C 957 nt10.55□□□□□ -0.72
CTR1P49573 RIB2YOL066C 1776 nt10.54□□□□□ -0.72
CTR1P49573 BMT6YLR063W 1098 nt10.52□□□□□ -0.73
CTR1P49573 PRY1YJL079C 900 nt10.49□□□□□ -0.73
CTR1P49573 CPD1YGR247W 720 nt10.47□□□□□ -0.73
CTR1P49573 BIO5YNR056C 1686 nt10.47□□□□□ -0.73
CTR1P49573 ESS1YJR017C 513 nt10.46□□□□□ -0.73
CTR1P49573 UME6YDR207C 2511 nt10.46□□□□□ -0.74
CTR1P49573 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.45□□□□□ -0.74
CTR1P49573 YPL251WYPL251W 303 nt10.45□□□□□ -0.74
CTR1P49573 HXT12YIL170W 1374 nt10.44□□□□□ -0.74
CTR1P49573 YJL055WYJL055W 738 nt10.44□□□□□ -0.74
CTR1P49573 SED1YDR077W 1017 nt10.42□□□□□ -0.74
CTR1P49573 IRC24YIR036C 792 nt10.41□□□□□ -0.74
CTR1P49573 DBP1YPL119C 1854 nt10.4□□□□□ -0.75
CTR1P49573 MCH5YOR306C 1566 nt10.39□□□□□ -0.75
CTR1P49573 ALD4YOR374W 1560 nt10.39□□□□□ -0.75
CTR1P49573 YBL086CYBL086C 1401 nt10.38□□□□□ -0.75
CTR1P49573 VRG4YGL225W 1014 nt10.36□□□□□ -0.75
CTR1P49573 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt10.36□□□□□ -0.75
CTR1P49573 LIP1YMR298W 453 nt10.36□□□□□ -0.75
CTR1P49573 CSM1YCR086W 573 nt10.35□□□□□ -0.75
CTR1P49573 PGC1YPL206C 966 nt10.35□□□□□ -0.75
CTR1P49573 NAR1YNL240C 1476 nt10.32□□□□□ -0.76
CTR1P49573 YMR103CYMR103C 363 nt10.32□□□□□ -0.76
CTR1P49573 LEU9YOR108W 1815 nt10.31□□□□□ -0.76
CTR1P49573 SAM3YPL274W 1764 nt10.31□□□□□ -0.76
CTR1P49573 BRR1YPR057W 1026 nt10.29□□□□□ -0.76
CTR1P49573 MEP3YPR138C 1470 nt10.29□□□□□ -0.76
CTR1P49573 PBP1YGR178C 2169 nt10.28□□□□□ -0.76
CTR1P49573 SAM35YHR083W 990 nt10.28□□□□□ -0.76
CTR1P49573 HIF1YLL022C 1158 nt10.28□□□□□ -0.76
CTR1P49573 PUP1YOR157C 786 nt10.28□□□□□ -0.76
CTR1P49573 CCT5YJR064W 1689 nt10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 63.1 ms