Protein–RNA interactions for Protein: P42843

SKP2, F-box protein SKP2, yeastyeast

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Length 763 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKP2P42843 YGR012WYGR012W 1182 nt10.93□□□□□ -0.66
SKP2P42843 PAU15YIR041W 375 nt10.93□□□□□ -0.66
SKP2P42843 TSC10YBR265W 963 nt10.93□□□□□ -0.66
SKP2P42843 AGP1YCL025C 1902 nt10.92□□□□□ -0.66
SKP2P42843 TIR3YIL011W 810 nt10.91□□□□□ -0.66
SKP2P42843 YJL195CYJL195C 702 nt10.91□□□□□ -0.66
SKP2P42843 YLR279WYLR279W 390 nt10.91□□□□□ -0.66
SKP2P42843 TOM6YOR045W 186 nt10.91□□□□□ -0.66
SKP2P42843 NBP35YGL091C 987 nt10.89□□□□□ -0.67
SKP2P42843 HIP1YGR191W 1812 nt10.88□□□□□ -0.67
SKP2P42843 PEX2YJL210W 816 nt10.87□□□□□ -0.67
SKP2P42843 NRT1YOR071C 1797 nt10.85□□□□□ -0.67
SKP2P42843 POM34YLR018C 900 nt10.84□□□□□ -0.67
SKP2P42843 ADH1YOL086C 1047 nt10.83□□□□□ -0.68
SKP2P42843 CCA1YER168C 1641 nt10.82□□□□□ -0.68
SKP2P42843 YFL054CYFL054C 1941 nt10.81□□□□□ -0.68
SKP2P42843 YML089CYML089C 369 nt10.79□□□□□ -0.68
SKP2P42843 GPN2YOR262W 1044 nt10.78□□□□□ -0.68
SKP2P42843 MET28YIR017C 564 nt10.77□□□□□ -0.69
SKP2P42843 PRO1YDR300C 1287 nt10.75□□□□□ -0.69
SKP2P42843 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.75□□□□□ -0.69
SKP2P42843 TIF6YPR016C 738 nt10.75□□□□□ -0.69
SKP2P42843 MSB4YOL112W 1479 nt10.74□□□□□ -0.69
SKP2P42843 YEL008WYEL008W 381 nt10.74□□□□□ -0.69
SKP2P42843 YPI1YFR003C 468 nt10.74□□□□□ -0.69
SKP2P42843 LSC2YGR244C 1284 nt10.73□□□□□ -0.69
SKP2P42843 ESS1YJR017C 513 nt10.73□□□□□ -0.69
SKP2P42843 CPD1YGR247W 720 nt10.72□□□□□ -0.69
SKP2P42843 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.69□□□□□ -0.7
SKP2P42843 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.69□□□□□ -0.7
SKP2P42843 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt10.68□□□□□ -0.7
SKP2P42843 ATG15YCR068W 1563 nt10.68□□□□□ -0.7
SKP2P42843 FIT3YOR383C 615 nt10.67□□□□□ -0.7
SKP2P42843 STR3YGL184C 1398 nt10.66□□□□□ -0.7
SKP2P42843 AQY2YLL052C 450 nt10.65□□□□□ -0.7
SKP2P42843 GND1YHR183W 1470 nt10.64□□□□□ -0.71
SKP2P42843 LOT5YKL183W 921 nt10.64□□□□□ -0.71
SKP2P42843 DUS1YML080W 1272 nt10.64□□□□□ -0.71
SKP2P42843 AAC1YMR056C 930 nt10.64□□□□□ -0.71
SKP2P42843 SWE1YJL187C 2460 nt10.61□□□□□ -0.71
SKP2P42843 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.59□□□□□ -0.71
SKP2P42843 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.59□□□□□ -0.71
SKP2P42843 APT2YDR441C 546 nt10.56□□□□□ -0.72
SKP2P42843 PUP1YOR157C 786 nt10.56□□□□□ -0.72
SKP2P42843 ARP6YLR085C 1317 nt10.56□□□□□ -0.72
SKP2P42843 NAP1YKR048C 1254 nt10.55□□□□□ -0.72
SKP2P42843 SEN2YLR105C 1134 nt10.55□□□□□ -0.72
SKP2P42843 GAP1YKR039W 1809 nt10.53□□□□□ -0.72
SKP2P42843 YCL074WYCL074W 927 nt10.5□□□□□ -0.73
SKP2P42843 SMM1YNR015W 1155 nt10.5□□□□□ -0.73
SKP2P42843 ALP1YNL270C 1722 nt10.46□□□□□ -0.74
SKP2P42843 RIB2YOL066C 1776 nt10.45□□□□□ -0.74
SKP2P42843 ZTA1YBR046C 1005 nt10.45□□□□□ -0.74
SKP2P42843 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.44□□□□□ -0.74
SKP2P42843 PGC1YPL206C 966 nt10.44□□□□□ -0.74
SKP2P42843 YAR028WYAR028W 705 nt10.43□□□□□ -0.74
SKP2P42843 YBR232CYBR232C 360 nt10.42□□□□□ -0.74
SKP2P42843 FCY21YER060W 1587 nt10.42□□□□□ -0.74
SKP2P42843 MTG2YHR168W 1557 nt10.41□□□□□ -0.74
SKP2P42843 DIF1YLR437C 402 nt10.41□□□□□ -0.74
SKP2P42843 PAU5YFL020C 369 nt10.4□□□□□ -0.74
SKP2P42843 AKR2YOR034C 2250 nt10.4□□□□□ -0.75
SKP2P42843 PLB1YMR008C 1995 nt10.39□□□□□ -0.75
SKP2P42843 HXT12YIL170W 1374 nt10.38□□□□□ -0.75
SKP2P42843 RTN2YDL204W 1182 nt10.37□□□□□ -0.75
SKP2P42843 STP3YLR375W 1032 nt10.36□□□□□ -0.75
SKP2P42843 YJL064WYJL064W 396 nt10.35□□□□□ -0.75
SKP2P42843 ALD4YOR374W 1560 nt10.34□□□□□ -0.75
SKP2P42843 FRE6YLL051C 2139 nt10.33□□□□□ -0.76
SKP2P42843 PRY1YJL079C 900 nt10.32□□□□□ -0.76
SKP2P42843 VRG4YGL225W 1014 nt10.31□□□□□ -0.76
SKP2P42843 PAU19YMR325W 375 nt10.3□□□□□ -0.76
SKP2P42843 UTR1YJR049C 1593 nt10.27□□□□□ -0.76
SKP2P42843 YJR114WYJR114W 393 nt10.27□□□□□ -0.77
SKP2P42843 TIM44YIL022W 1296 nt10.26□□□□□ -0.77
SKP2P42843 CCT5YJR064W 1689 nt10.25□□□□□ -0.77
SKP2P42843 UGA4YDL210W 1716 nt10.25□□□□□ -0.77
SKP2P42843 YJL055WYJL055W 738 nt10.24□□□□□ -0.77
SKP2P42843 SLG1YOR008C 1137 nt10.24□□□□□ -0.77
SKP2P42843 HSP60YLR259C 1719 nt10.21□□□□□ -0.77
SKP2P42843 BOR1YNL275W 1731 nt10.21□□□□□ -0.78
SKP2P42843 FUR4YBR021W 1902 nt10.21□□□□□ -0.78
SKP2P42843 UME6YDR207C 2511 nt10.2□□□□□ -0.78
SKP2P42843 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.19□□□□□ -0.78
SKP2P42843 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.19□□□□□ -0.78
SKP2P42843 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.19□□□□□ -0.78
SKP2P42843 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.19□□□□□ -0.78
SKP2P42843 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.19□□□□□ -0.78
SKP2P42843 SED1YDR077W 1017 nt10.17□□□□□ -0.78
SKP2P42843 TAF13YML098W 504 nt10.14□□□□□ -0.79
SKP2P42843 RIB1YBL033C 1038 nt10.14□□□□□ -0.79
SKP2P42843 THI72YOR192C 1800 nt10.12□□□□□ -0.79
SKP2P42843 CSM1YCR086W 573 nt10.11□□□□□ -0.79
SKP2P42843 SAM35YHR083W 990 nt10.1□□□□□ -0.79
SKP2P42843 TIP1YBR067C 633 nt10.1□□□□□ -0.79
SKP2P42843 YGR259CYGR259C 441 nt10.09□□□□□ -0.79
SKP2P42843 ERG6YML008C 1152 nt10.09□□□□□ -0.79
SKP2P42843 LIP1YMR298W 453 nt10.09□□□□□ -0.79
SKP2P42843 GAL3YDR009W 1563 nt10.08□□□□□ -0.8
SKP2P42843 YMR262WYMR262W 942 nt10.07□□□□□ -0.8
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