Protein–RNA interactions for Protein: P40550

PDR11, ATP-dependent permease PDR11, yeastyeast

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR11P40550 YGR012WYGR012W 1182 nt13.92□□□□□ -0.18
PDR11P40550 HIP1YGR191W 1812 nt13.91□□□□□ -0.18
PDR11P40550 PRO1YDR300C 1287 nt13.89□□□□□ -0.19
PDR11P40550 UTH1YKR042W 1098 nt13.88□□□□□ -0.19
PDR11P40550 POM34YLR018C 900 nt13.88□□□□□ -0.19
PDR11P40550 YLR279WYLR279W 390 nt13.88□□□□□ -0.19
PDR11P40550 STR3YGL184C 1398 nt13.87□□□□□ -0.19
PDR11P40550 YLR349WYLR349W 507 nt13.86□□□□□ -0.19
PDR11P40550 CLB6YGR109C 1143 nt13.85□□□□□ -0.19
PDR11P40550 RAD23YEL037C 1197 nt13.84□□□□□ -0.19
PDR11P40550 STE4YOR212W 1272 nt13.84□□□□□ -0.19
PDR11P40550 NRT1YOR071C 1797 nt13.84□□□□□ -0.19
PDR11P40550 MSB4YOL112W 1479 nt13.84□□□□□ -0.19
PDR11P40550 ATG15YCR068W 1563 nt13.8□□□□□ -0.2
PDR11P40550 TIF6YPR016C 738 nt13.8□□□□□ -0.2
PDR11P40550 TSC10YBR265W 963 nt13.8□□□□□ -0.2
PDR11P40550 ADH7YCR105W 1086 nt13.78□□□□□ -0.2
PDR11P40550 PAU15YIR041W 375 nt13.73□□□□□ -0.21
PDR11P40550 RIB3YDR487C 627 nt13.72□□□□□ -0.21
PDR11P40550 YCL074WYCL074W 927 nt13.7□□□□□ -0.22
PDR11P40550 ZTA1YBR046C 1005 nt13.67□□□□□ -0.22
PDR11P40550 MET28YIR017C 564 nt13.65□□□□□ -0.22
PDR11P40550 YJL195CYJL195C 702 nt13.65□□□□□ -0.22
PDR11P40550 GPN2YOR262W 1044 nt13.65□□□□□ -0.22
PDR11P40550 FUN14YAL008W 597 nt13.64□□□□□ -0.23
PDR11P40550 YML089CYML089C 369 nt13.64□□□□□ -0.23
PDR11P40550 ADH1YOL086C 1047 nt13.64□□□□□ -0.23
PDR11P40550 AAC1YMR056C 930 nt13.63□□□□□ -0.23
PDR11P40550 LSC2YGR244C 1284 nt13.61□□□□□ -0.23
PDR11P40550 LOT5YKL183W 921 nt13.59□□□□□ -0.23
PDR11P40550 GAP1YKR039W 1809 nt13.58□□□□□ -0.24
PDR11P40550 PLB1YMR008C 1995 nt13.57□□□□□ -0.24
PDR11P40550 FUR4YBR021W 1902 nt13.57□□□□□ -0.24
PDR11P40550 ARP6YLR085C 1317 nt13.56□□□□□ -0.24
PDR11P40550 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt13.56□□□□□ -0.24
PDR11P40550 APT2YDR441C 546 nt13.53□□□□□ -0.24
PDR11P40550 AKR2YOR034C 2250 nt13.5□□□□□ -0.25
PDR11P40550 GND1YHR183W 1470 nt13.48□□□□□ -0.25
PDR11P40550 RTN2YDL204W 1182 nt13.46□□□□□ -0.26
PDR11P40550 DIF1YLR437C 402 nt13.46□□□□□ -0.26
PDR11P40550 YPI1YFR003C 468 nt13.45□□□□□ -0.26
PDR11P40550 FIT3YOR383C 615 nt13.45□□□□□ -0.26
PDR11P40550 UTR1YJR049C 1593 nt13.42□□□□□ -0.26
PDR11P40550 RIB2YOL066C 1776 nt13.41□□□□□ -0.26
PDR11P40550 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt13.41□□□□□ -0.26
PDR11P40550 SMM1YNR015W 1155 nt13.41□□□□□ -0.26
PDR11P40550 ESS1YJR017C 513 nt13.4□□□□□ -0.26
PDR11P40550 YEL008WYEL008W 381 nt13.39□□□□□ -0.27
PDR11P40550 MTG2YHR168W 1557 nt13.39□□□□□ -0.27
PDR11P40550 YAR028WYAR028W 705 nt13.39□□□□□ -0.27
PDR11P40550 CPD1YGR247W 720 nt13.38□□□□□ -0.27
PDR11P40550 UGA4YDL210W 1716 nt13.36□□□□□ -0.27
PDR11P40550 YER190C-AYER190C-A 576 nt13.33□□□□□ -0.28
PDR11P40550 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt13.33□□□□□ -0.28
PDR11P40550 YML133W-AYML133W-A 576 nt13.33□□□□□ -0.28
PDR11P40550 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt13.33□□□□□ -0.28
PDR11P40550 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt13.33□□□□□ -0.28
PDR11P40550 LSB3YFR024C-A 1380 nt13.31□□□□□ -0.28
PDR11P40550 YJL055WYJL055W 738 nt13.3□□□□□ -0.28
PDR11P40550 YKR005CYKR005C 1578 nt13.3□□□□□ -0.28
PDR11P40550 PRY1YJL079C 900 nt13.3□□□□□ -0.28
PDR11P40550 ALP1YNL270C 1722 nt13.29□□□□□ -0.28
PDR11P40550 PUP1YOR157C 786 nt13.29□□□□□ -0.28
PDR11P40550 YGR259CYGR259C 441 nt13.28□□□□□ -0.28
PDR11P40550 PRM5YIL117C 957 nt13.28□□□□□ -0.28
PDR11P40550 NAP1YKR048C 1254 nt13.26□□□□□ -0.29
PDR11P40550 PAC11YDR488C 1602 nt13.25□□□□□ -0.29
PDR11P40550 FCY21YER060W 1587 nt13.25□□□□□ -0.29
PDR11P40550 SEN2YLR105C 1134 nt13.24□□□□□ -0.29
PDR11P40550 ALD4YOR374W 1560 nt13.19□□□□□ -0.3
PDR11P40550 VRG4YGL225W 1014 nt13.16□□□□□ -0.3
PDR11P40550 PGC1YPL206C 966 nt13.16□□□□□ -0.3
PDR11P40550 YPL251WYPL251W 303 nt13.15□□□□□ -0.3
PDR11P40550 PAU5YFL020C 369 nt13.14□□□□□ -0.31
PDR11P40550 SED1YDR077W 1017 nt13.13□□□□□ -0.31
PDR11P40550 HXT12YIL170W 1374 nt13.13□□□□□ -0.31
PDR11P40550 HSP60YLR259C 1719 nt13.1□□□□□ -0.31
PDR11P40550 YJR114WYJR114W 393 nt13.09□□□□□ -0.31
PDR11P40550 PRP4YPR178W 1398 nt13.07□□□□□ -0.32
PDR11P40550 MEP3YPR138C 1470 nt13.06□□□□□ -0.32
PDR11P40550 YMR103CYMR103C 363 nt13.05□□□□□ -0.32
PDR11P40550 LIP1YMR298W 453 nt13.05□□□□□ -0.32
PDR11P40550 YBL086CYBL086C 1401 nt13.03□□□□□ -0.32
PDR11P40550 DPS1YLL018C 1674 nt13.02□□□□□ -0.33
PDR11P40550 CSM1YCR086W 573 nt13□□□□□ -0.33
PDR11P40550 YBR232CYBR232C 360 nt12.98□□□□□ -0.33
PDR11P40550 CCT5YJR064W 1689 nt12.96□□□□□ -0.33
PDR11P40550 SAM35YHR083W 990 nt12.96□□□□□ -0.34
PDR11P40550 YJL064WYJL064W 396 nt12.96□□□□□ -0.34
PDR11P40550 YJL118WYJL118W 660 nt12.96□□□□□ -0.34
PDR11P40550 SNZ1YMR096W 894 nt12.96□□□□□ -0.34
PDR11P40550 SNF1YDR477W 1902 nt12.95□□□□□ -0.34
PDR11P40550 BRR1YPR057W 1026 nt12.95□□□□□ -0.34
PDR11P40550 SAM3YPL274W 1764 nt12.94□□□□□ -0.34
PDR11P40550 TOA2YKL058W 369 nt12.94□□□□□ -0.34
PDR11P40550 GAL3YDR009W 1563 nt12.94□□□□□ -0.34
PDR11P40550 DBP1YPL119C 1854 nt12.94□□□□□ -0.34
PDR11P40550 THI72YOR192C 1800 nt12.92□□□□□ -0.34
PDR11P40550 BMT6YLR063W 1098 nt12.92□□□□□ -0.34
PDR11P40550 IRC24YIR036C 792 nt12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 55.6 ms