Protein–RNA interactions for Protein: P40061

TSC11, Target of rapamycin complex 2 subunit TSC11, yeastyeast

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TSC11P40061 FUN14YAL008W 597 nt15.45■□□□□ 0.06
TSC11P40061 GPN2YOR262W 1044 nt15.44■□□□□ 0.06
TSC11P40061 YJL195CYJL195C 702 nt15.43■□□□□ 0.06
TSC11P40061 TSC10YBR265W 963 nt15.43■□□□□ 0.06
TSC11P40061 YFL054CYFL054C 1941 nt15.39■□□□□ 0.05
TSC11P40061 NRT1YOR071C 1797 nt15.35■□□□□ 0.05
TSC11P40061 RIB3YDR487C 627 nt15.34■□□□□ 0.05
TSC11P40061 HIP1YGR191W 1812 nt15.34■□□□□ 0.05
TSC11P40061 TIR3YIL011W 810 nt15.34■□□□□ 0.05
TSC11P40061 CCA1YER168C 1641 nt15.33■□□□□ 0.04
TSC11P40061 MSB4YOL112W 1479 nt15.3■□□□□ 0.04
TSC11P40061 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt15.29■□□□□ 0.04
TSC11P40061 ADH1YOL086C 1047 nt15.29■□□□□ 0.04
TSC11P40061 NBP35YGL091C 987 nt15.26■□□□□ 0.03
TSC11P40061 AQY2YLL052C 450 nt15.21■□□□□ 0.03
TSC11P40061 CPD1YGR247W 720 nt15.2■□□□□ 0.02
TSC11P40061 POM34YLR018C 900 nt15.2■□□□□ 0.02
TSC11P40061 PRO1YDR300C 1287 nt15.19■□□□□ 0.02
TSC11P40061 ESS1YJR017C 513 nt15.19■□□□□ 0.02
TSC11P40061 DUS1YML080W 1272 nt15.19■□□□□ 0.02
TSC11P40061 AAC1YMR056C 930 nt15.19■□□□□ 0.02
TSC11P40061 LOT5YKL183W 921 nt15.17■□□□□ 0.02
TSC11P40061 ATG15YCR068W 1563 nt15.17■□□□□ 0.02
TSC11P40061 TIF6YPR016C 738 nt15.16■□□□□ 0.02
TSC11P40061 YEL008WYEL008W 381 nt15.14■□□□□ 0.01
TSC11P40061 YPI1YFR003C 468 nt15.13■□□□□ 0.01
TSC11P40061 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt15.13■□□□□ 0.01
TSC11P40061 MET28YIR017C 564 nt15.11■□□□□ 0.01
TSC11P40061 SWE1YJL187C 2460 nt15.08■□□□□ 0
TSC11P40061 YML089CYML089C 369 nt15.08■□□□□ 0
TSC11P40061 APT2YDR441C 546 nt15.02■□□□□ -0
TSC11P40061 SEN2YLR105C 1134 nt15.02■□□□□ -0
TSC11P40061 RDN18-1RDN18-1 1800 nt15.02■□□□□ -0
TSC11P40061 RDN18-2RDN18-2 1800 nt15.02■□□□□ -0
TSC11P40061 GND1YHR183W 1470 nt15.02□□□□□ -0.01
TSC11P40061 PUP1YOR157C 786 nt14.99□□□□□ -0.01
TSC11P40061 STR3YGL184C 1398 nt14.97□□□□□ -0.01
TSC11P40061 LSC2YGR244C 1284 nt14.95□□□□□ -0.02
TSC11P40061 FIT3YOR383C 615 nt14.95□□□□□ -0.02
TSC11P40061 ZTA1YBR046C 1005 nt14.95□□□□□ -0.02
TSC11P40061 NAP1YKR048C 1254 nt14.92□□□□□ -0.02
TSC11P40061 RIB2YOL066C 1776 nt14.9□□□□□ -0.02
TSC11P40061 AKR2YOR034C 2250 nt14.86□□□□□ -0.03
TSC11P40061 LSB3YFR024C-A 1380 nt14.86□□□□□ -0.03
TSC11P40061 PAU5YFL020C 369 nt14.85□□□□□ -0.03
TSC11P40061 SMM1YNR015W 1155 nt14.85□□□□□ -0.03
TSC11P40061 PGC1YPL206C 966 nt14.83□□□□□ -0.03
TSC11P40061 GAP1YKR039W 1809 nt14.82□□□□□ -0.04
TSC11P40061 YCL074WYCL074W 927 nt14.81□□□□□ -0.04
TSC11P40061 ARP6YLR085C 1317 nt14.74□□□□□ -0.05
TSC11P40061 YAR028WYAR028W 705 nt14.73□□□□□ -0.05
TSC11P40061 PRY1YJL079C 900 nt14.72□□□□□ -0.05
TSC11P40061 YJL064WYJL064W 396 nt14.7□□□□□ -0.06
TSC11P40061 YJL055WYJL055W 738 nt14.69□□□□□ -0.06
TSC11P40061 YBR232CYBR232C 360 nt14.69□□□□□ -0.06
TSC11P40061 PLB1YMR008C 1995 nt14.69□□□□□ -0.06
TSC11P40061 DIF1YLR437C 402 nt14.68□□□□□ -0.06
TSC11P40061 ALD4YOR374W 1560 nt14.67□□□□□ -0.06
TSC11P40061 ALP1YNL270C 1722 nt14.67□□□□□ -0.06
TSC11P40061 YJR114WYJR114W 393 nt14.66□□□□□ -0.06
TSC11P40061 MTG2YHR168W 1557 nt14.65□□□□□ -0.06
TSC11P40061 RTN2YDL204W 1182 nt14.64□□□□□ -0.07
TSC11P40061 VRG4YGL225W 1014 nt14.63□□□□□ -0.07
TSC11P40061 PAU19YMR325W 375 nt14.63□□□□□ -0.07
TSC11P40061 UGA4YDL210W 1716 nt14.63□□□□□ -0.07
TSC11P40061 SLG1YOR008C 1137 nt14.62□□□□□ -0.07
TSC11P40061 FCY21YER060W 1587 nt14.62□□□□□ -0.07
TSC11P40061 FUR4YBR021W 1902 nt14.57□□□□□ -0.08
TSC11P40061 HXT12YIL170W 1374 nt14.56□□□□□ -0.08
TSC11P40061 UTR1YJR049C 1593 nt14.54□□□□□ -0.08
TSC11P40061 STP3YLR375W 1032 nt14.52□□□□□ -0.08
TSC11P40061 TIM44YIL022W 1296 nt14.5□□□□□ -0.09
TSC11P40061 THI72YOR192C 1800 nt14.46□□□□□ -0.09
TSC11P40061 YER190C-AYER190C-A 576 nt14.46□□□□□ -0.09
TSC11P40061 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt14.46□□□□□ -0.09
TSC11P40061 YML133W-AYML133W-A 576 nt14.46□□□□□ -0.09
TSC11P40061 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt14.46□□□□□ -0.09
TSC11P40061 TIP1YBR067C 633 nt14.46□□□□□ -0.09
TSC11P40061 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt14.46□□□□□ -0.09
TSC11P40061 CCT5YJR064W 1689 nt14.45□□□□□ -0.1
TSC11P40061 SED1YDR077W 1017 nt14.42□□□□□ -0.1
TSC11P40061 HSP60YLR259C 1719 nt14.42□□□□□ -0.1
TSC11P40061 ERG6YML008C 1152 nt14.36□□□□□ -0.11
TSC11P40061 TAF13YML098W 504 nt14.33□□□□□ -0.11
TSC11P40061 RIB1YBL033C 1038 nt14.33□□□□□ -0.11
TSC11P40061 MEP3YPR138C 1470 nt14.32□□□□□ -0.12
TSC11P40061 YPL251WYPL251W 303 nt14.32□□□□□ -0.12
TSC11P40061 PRM5YIL117C 957 nt14.31□□□□□ -0.12
TSC11P40061 YJL118WYJL118W 660 nt14.3□□□□□ -0.12
TSC11P40061 YMR262WYMR262W 942 nt14.3□□□□□ -0.12
TSC11P40061 SOD2YHR008C 702 nt14.29□□□□□ -0.12
TSC11P40061 YKR005CYKR005C 1578 nt14.28□□□□□ -0.12
TSC11P40061 GAL3YDR009W 1563 nt14.27□□□□□ -0.13
TSC11P40061 SNZ1YMR096W 894 nt14.26□□□□□ -0.13
TSC11P40061 YGR259CYGR259C 441 nt14.25□□□□□ -0.13
TSC11P40061 CSM1YCR086W 573 nt14.24□□□□□ -0.13
TSC11P40061 LIP1YMR298W 453 nt14.24□□□□□ -0.13
TSC11P40061 LSB5YCL034W 1065 nt14.24□□□□□ -0.13
TSC11P40061 PAC11YDR488C 1602 nt14.24□□□□□ -0.13
TSC11P40061 SAM35YHR083W 990 nt14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.4 ms