Protein–RNA interactions for Protein: P38904

SPP41, Protein SPP41, yeastyeast

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPP41P38904 TOM6YOR045W 186 nt15.57■□□□□ 0.08
SPP41P38904 FUN14YAL008W 597 nt15.56■□□□□ 0.08
SPP41P38904 TSC10YBR265W 963 nt15.54■□□□□ 0.08
SPP41P38904 YJL195CYJL195C 702 nt15.53■□□□□ 0.08
SPP41P38904 GPN2YOR262W 1044 nt15.53■□□□□ 0.08
SPP41P38904 RIB3YDR487C 627 nt15.46■□□□□ 0.07
SPP41P38904 TIR3YIL011W 810 nt15.46■□□□□ 0.07
SPP41P38904 HIP1YGR191W 1812 nt15.45■□□□□ 0.06
SPP41P38904 CCA1YER168C 1641 nt15.45■□□□□ 0.06
SPP41P38904 NRT1YOR071C 1797 nt15.45■□□□□ 0.06
SPP41P38904 MSB4YOL112W 1479 nt15.42■□□□□ 0.06
SPP41P38904 ADH1YOL086C 1047 nt15.41■□□□□ 0.06
SPP41P38904 PAC11YDR488C 1602 nt15.4■□□□□ 0.06
SPP41P38904 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt15.39■□□□□ 0.05
SPP41P38904 NBP35YGL091C 987 nt15.38■□□□□ 0.05
SPP41P38904 POM34YLR018C 900 nt15.32■□□□□ 0.04
SPP41P38904 CPD1YGR247W 720 nt15.31■□□□□ 0.04
SPP41P38904 AQY2YLL052C 450 nt15.31■□□□□ 0.04
SPP41P38904 SWE1YJL187C 2460 nt15.31■□□□□ 0.04
SPP41P38904 PRO1YDR300C 1287 nt15.29■□□□□ 0.04
SPP41P38904 ESS1YJR017C 513 nt15.29■□□□□ 0.04
SPP41P38904 AAC1YMR056C 930 nt15.29■□□□□ 0.04
SPP41P38904 ATG15YCR068W 1563 nt15.28■□□□□ 0.04
SPP41P38904 LOT5YKL183W 921 nt15.28■□□□□ 0.04
SPP41P38904 DUS1YML080W 1272 nt15.28■□□□□ 0.04
SPP41P38904 TIF6YPR016C 738 nt15.27■□□□□ 0.04
SPP41P38904 YEL008WYEL008W 381 nt15.26■□□□□ 0.03
SPP41P38904 YPI1YFR003C 468 nt15.25■□□□□ 0.03
SPP41P38904 MET28YIR017C 564 nt15.23■□□□□ 0.03
SPP41P38904 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt15.23■□□□□ 0.03
SPP41P38904 YML089CYML089C 369 nt15.19■□□□□ 0.02
SPP41P38904 RDN18-1RDN18-1 1800 nt15.13■□□□□ 0.01
SPP41P38904 RDN18-2RDN18-2 1800 nt15.13■□□□□ 0.01
SPP41P38904 SEN2YLR105C 1134 nt15.13■□□□□ 0.01
SPP41P38904 GND1YHR183W 1470 nt15.13■□□□□ 0.01
SPP41P38904 APT2YDR441C 546 nt15.12■□□□□ 0.01
SPP41P38904 PUP1YOR157C 786 nt15.09■□□□□ 0.01
SPP41P38904 LSC2YGR244C 1284 nt15.08■□□□□ 0
SPP41P38904 FIT3YOR383C 615 nt15.08■□□□□ 0
SPP41P38904 STR3YGL184C 1398 nt15.08■□□□□ 0
SPP41P38904 ZTA1YBR046C 1005 nt15.07■□□□□ 0
SPP41P38904 NAP1YKR048C 1254 nt15.03■□□□□ -0
SPP41P38904 RIB2YOL066C 1776 nt15.01□□□□□ -0.01
SPP41P38904 AKR2YOR034C 2250 nt14.98□□□□□ -0.01
SPP41P38904 LSB3YFR024C-A 1380 nt14.98□□□□□ -0.01
SPP41P38904 SMM1YNR015W 1155 nt14.95□□□□□ -0.02
SPP41P38904 PGC1YPL206C 966 nt14.95□□□□□ -0.02
SPP41P38904 PAU5YFL020C 369 nt14.94□□□□□ -0.02
SPP41P38904 YCL074WYCL074W 927 nt14.92□□□□□ -0.02
SPP41P38904 GAP1YKR039W 1809 nt14.92□□□□□ -0.02
SPP41P38904 ARP6YLR085C 1317 nt14.87□□□□□ -0.03
SPP41P38904 FUR4YBR021W 1902 nt14.86□□□□□ -0.03
SPP41P38904 YAR028WYAR028W 705 nt14.85□□□□□ -0.03
SPP41P38904 PRY1YJL079C 900 nt14.83□□□□□ -0.04
SPP41P38904 DIF1YLR437C 402 nt14.81□□□□□ -0.04
SPP41P38904 YBR232CYBR232C 360 nt14.81□□□□□ -0.04
SPP41P38904 YJL055WYJL055W 738 nt14.8□□□□□ -0.04
SPP41P38904 YJL064WYJL064W 396 nt14.8□□□□□ -0.04
SPP41P38904 PLB1YMR008C 1995 nt14.8□□□□□ -0.04
SPP41P38904 ALD4YOR374W 1560 nt14.78□□□□□ -0.04
SPP41P38904 ALP1YNL270C 1722 nt14.77□□□□□ -0.04
SPP41P38904 YJR114WYJR114W 393 nt14.77□□□□□ -0.04
SPP41P38904 MTG2YHR168W 1557 nt14.76□□□□□ -0.05
SPP41P38904 RTN2YDL204W 1182 nt14.75□□□□□ -0.05
SPP41P38904 PAU19YMR325W 375 nt14.75□□□□□ -0.05
SPP41P38904 UGA4YDL210W 1716 nt14.74□□□□□ -0.05
SPP41P38904 FCY21YER060W 1587 nt14.74□□□□□ -0.05
SPP41P38904 VRG4YGL225W 1014 nt14.73□□□□□ -0.05
SPP41P38904 HSP60YLR259C 1719 nt14.72□□□□□ -0.05
SPP41P38904 SLG1YOR008C 1137 nt14.72□□□□□ -0.05
SPP41P38904 HXT12YIL170W 1374 nt14.69□□□□□ -0.06
SPP41P38904 BOR1YNL275W 1731 nt14.67□□□□□ -0.06
SPP41P38904 UTR1YJR049C 1593 nt14.65□□□□□ -0.06
SPP41P38904 STP3YLR375W 1032 nt14.63□□□□□ -0.07
SPP41P38904 TIM44YIL022W 1296 nt14.6□□□□□ -0.07
SPP41P38904 THI72YOR192C 1800 nt14.58□□□□□ -0.08
SPP41P38904 CCT5YJR064W 1689 nt14.57□□□□□ -0.08
SPP41P38904 YER190C-AYER190C-A 576 nt14.56□□□□□ -0.08
SPP41P38904 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt14.56□□□□□ -0.08
SPP41P38904 YML133W-AYML133W-A 576 nt14.56□□□□□ -0.08
SPP41P38904 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt14.56□□□□□ -0.08
SPP41P38904 TIP1YBR067C 633 nt14.56□□□□□ -0.08
SPP41P38904 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt14.56□□□□□ -0.08
SPP41P38904 SED1YDR077W 1017 nt14.54□□□□□ -0.08
SPP41P38904 YKR005CYKR005C 1578 nt14.52□□□□□ -0.09
SPP41P38904 PRP4YPR178W 1398 nt14.49□□□□□ -0.09
SPP41P38904 YGR259CYGR259C 441 nt14.46□□□□□ -0.09
SPP41P38904 ERG6YML008C 1152 nt14.46□□□□□ -0.09
SPP41P38904 BMT6YLR063W 1098 nt14.43□□□□□ -0.1
SPP41P38904 YPL251WYPL251W 303 nt14.43□□□□□ -0.1
SPP41P38904 TAF13YML098W 504 nt14.42□□□□□ -0.1
SPP41P38904 RIB1YBL033C 1038 nt14.42□□□□□ -0.1
SPP41P38904 MEP3YPR138C 1470 nt14.42□□□□□ -0.1
SPP41P38904 PRM5YIL117C 957 nt14.41□□□□□ -0.1
SPP41P38904 YJL118WYJL118W 660 nt14.41□□□□□ -0.1
SPP41P38904 YMR262WYMR262W 942 nt14.41□□□□□ -0.1
SPP41P38904 DPS1YLL018C 1674 nt14.39□□□□□ -0.11
SPP41P38904 GAL3YDR009W 1563 nt14.38□□□□□ -0.11
SPP41P38904 SOD2YHR008C 702 nt14.37□□□□□ -0.11
SPP41P38904 SNZ1YMR096W 894 nt14.37□□□□□ -0.11
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