Protein–RNA interactions for Protein: P38351

PAF1, RNA polymerase II-associated protein 1, yeastyeast

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PAF1P38351 RDN37-2RDN37-2 5354 nt13.96□□□□□ -0.17
PAF1P38351 POM34YLR018C 900 nt13.94□□□□□ -0.18
PAF1P38351 RDN18-1RDN18-1 1800 nt13.94□□□□□ -0.18
PAF1P38351 RDN18-2RDN18-2 1800 nt13.94□□□□□ -0.18
PAF1P38351 LSC2YGR244C 1284 nt13.92□□□□□ -0.18
PAF1P38351 YML089CYML089C 369 nt13.92□□□□□ -0.18
PAF1P38351 PEX2YJL210W 816 nt13.91□□□□□ -0.18
PAF1P38351 HIP1YGR191W 1812 nt13.88□□□□□ -0.19
PAF1P38351 PRO1YDR300C 1287 nt13.88□□□□□ -0.19
PAF1P38351 RAD23YEL037C 1197 nt13.86□□□□□ -0.19
PAF1P38351 NRT1YOR071C 1797 nt13.86□□□□□ -0.19
PAF1P38351 SAM1YLR180W 1149 nt13.85□□□□□ -0.19
PAF1P38351 TSC10YBR265W 963 nt13.83□□□□□ -0.2
PAF1P38351 ATG15YCR068W 1563 nt13.83□□□□□ -0.2
PAF1P38351 MET28YIR017C 564 nt13.8□□□□□ -0.2
PAF1P38351 TIF6YPR016C 738 nt13.79□□□□□ -0.2
PAF1P38351 ARP6YLR085C 1317 nt13.79□□□□□ -0.2
PAF1P38351 FUR4YBR021W 1902 nt13.78□□□□□ -0.2
PAF1P38351 YGR012WYGR012W 1182 nt13.78□□□□□ -0.2
PAF1P38351 RTN2YDL204W 1182 nt13.73□□□□□ -0.21
PAF1P38351 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt13.72□□□□□ -0.21
PAF1P38351 GAP1YKR039W 1809 nt13.71□□□□□ -0.22
PAF1P38351 RIB3YDR487C 627 nt13.7□□□□□ -0.22
PAF1P38351 FIT3YOR383C 615 nt13.68□□□□□ -0.22
PAF1P38351 YLR279WYLR279W 390 nt13.67□□□□□ -0.22
PAF1P38351 CAB5YDR196C 726 nt13.65□□□□□ -0.22
PAF1P38351 PLB1YMR008C 1995 nt13.64□□□□□ -0.23
PAF1P38351 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt13.59□□□□□ -0.23
PAF1P38351 MSB4YOL112W 1479 nt13.58□□□□□ -0.24
PAF1P38351 YGR259CYGR259C 441 nt13.56□□□□□ -0.24
PAF1P38351 YKR005CYKR005C 1578 nt13.55□□□□□ -0.24
PAF1P38351 DIF1YLR437C 402 nt13.51□□□□□ -0.25
PAF1P38351 YAR028WYAR028W 705 nt13.5□□□□□ -0.25
PAF1P38351 ALP1YNL270C 1722 nt13.47□□□□□ -0.25
PAF1P38351 PRP4YPR178W 1398 nt13.46□□□□□ -0.25
PAF1P38351 UTR1YJR049C 1593 nt13.46□□□□□ -0.25
PAF1P38351 RAD51YER095W 1203 nt13.44□□□□□ -0.26
PAF1P38351 STE4YOR212W 1272 nt13.44□□□□□ -0.26
PAF1P38351 YPI1YFR003C 468 nt13.43□□□□□ -0.26
PAF1P38351 YJL195CYJL195C 702 nt13.43□□□□□ -0.26
PAF1P38351 HSP60YLR259C 1719 nt13.43□□□□□ -0.26
PAF1P38351 AKR2YOR034C 2250 nt13.43□□□□□ -0.26
PAF1P38351 FUN14YAL008W 597 nt13.42□□□□□ -0.26
PAF1P38351 BMT6YLR063W 1098 nt13.42□□□□□ -0.26
PAF1P38351 ZTA1YBR046C 1005 nt13.42□□□□□ -0.26
PAF1P38351 GND1YHR183W 1470 nt13.42□□□□□ -0.26
PAF1P38351 LOT5YKL183W 921 nt13.41□□□□□ -0.26
PAF1P38351 MTG2YHR168W 1557 nt13.41□□□□□ -0.26
PAF1P38351 ADH1YOL086C 1047 nt13.4□□□□□ -0.26
PAF1P38351 BOR1YNL275W 1731 nt13.38□□□□□ -0.27
PAF1P38351 SAM35YHR083W 990 nt13.37□□□□□ -0.27
PAF1P38351 YLR349WYLR349W 507 nt13.36□□□□□ -0.27
PAF1P38351 DPS1YLL018C 1674 nt13.35□□□□□ -0.27
PAF1P38351 UME6YDR207C 2511 nt13.35□□□□□ -0.27
PAF1P38351 YNR029CYNR029C 1290 nt13.32□□□□□ -0.28
PAF1P38351 AAC1YMR056C 930 nt13.31□□□□□ -0.28
PAF1P38351 SMM1YNR015W 1155 nt13.29□□□□□ -0.28
PAF1P38351 APT2YDR441C 546 nt13.28□□□□□ -0.28
PAF1P38351 PRM5YIL117C 957 nt13.28□□□□□ -0.28
PAF1P38351 ADH7YCR105W 1086 nt13.27□□□□□ -0.29
PAF1P38351 IRC24YIR036C 792 nt13.27□□□□□ -0.29
PAF1P38351 FCY21YER060W 1587 nt13.27□□□□□ -0.29
PAF1P38351 SED1YDR077W 1017 nt13.26□□□□□ -0.29
PAF1P38351 YEL008WYEL008W 381 nt13.23□□□□□ -0.29
PAF1P38351 PAU15YIR041W 375 nt13.23□□□□□ -0.29
PAF1P38351 LSB3YFR024C-A 1380 nt13.22□□□□□ -0.29
PAF1P38351 YER190C-AYER190C-A 576 nt13.22□□□□□ -0.29
PAF1P38351 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt13.22□□□□□ -0.29
PAF1P38351 YML133W-AYML133W-A 576 nt13.22□□□□□ -0.29
PAF1P38351 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt13.22□□□□□ -0.29
PAF1P38351 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt13.22□□□□□ -0.29
PAF1P38351 LIP1YMR298W 453 nt13.19□□□□□ -0.3
PAF1P38351 RPM1RPM1 483 nt13.18□□□□□ -0.3
PAF1P38351 GPN2YOR262W 1044 nt13.18□□□□□ -0.3
PAF1P38351 UGA4YDL210W 1716 nt13.14□□□□□ -0.31
PAF1P38351 PRY1YJL079C 900 nt13.14□□□□□ -0.31
PAF1P38351 RIB2YOL066C 1776 nt13.14□□□□□ -0.31
PAF1P38351 CPD1YGR247W 720 nt13.12□□□□□ -0.31
PAF1P38351 ALD4YOR374W 1560 nt13.11□□□□□ -0.31
PAF1P38351 HXT12YIL170W 1374 nt13.09□□□□□ -0.31
PAF1P38351 DBP1YPL119C 1854 nt13.09□□□□□ -0.31
PAF1P38351 HXT1YHR094C 1713 nt13.08□□□□□ -0.32
PAF1P38351 VRG4YGL225W 1014 nt13.08□□□□□ -0.32
PAF1P38351 SNF1YDR477W 1902 nt13.07□□□□□ -0.32
PAF1P38351 YPL251WYPL251W 303 nt13.06□□□□□ -0.32
PAF1P38351 YBL086CYBL086C 1401 nt13.04□□□□□ -0.32
PAF1P38351 BRR1YPR057W 1026 nt13.03□□□□□ -0.32
PAF1P38351 MEP3YPR138C 1470 nt13.03□□□□□ -0.32
PAF1P38351 LEU9YOR108W 1815 nt13□□□□□ -0.33
PAF1P38351 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt13□□□□□ -0.33
PAF1P38351 YJL055WYJL055W 738 nt13□□□□□ -0.33
PAF1P38351 TOA2YKL058W 369 nt13□□□□□ -0.33
PAF1P38351 HIF1YLL022C 1158 nt13□□□□□ -0.33
PAF1P38351 YMR103CYMR103C 363 nt12.99□□□□□ -0.33
PAF1P38351 ESS1YJR017C 513 nt12.98□□□□□ -0.33
PAF1P38351 MCH5YOR306C 1566 nt12.96□□□□□ -0.33
PAF1P38351 CSM1YCR086W 573 nt12.93□□□□□ -0.34
PAF1P38351 LSB5YCL034W 1065 nt12.93□□□□□ -0.34
PAF1P38351 ALG12YNR030W 1656 nt12.89□□□□□ -0.35
PAF1P38351 GND2YGR256W 1479 nt12.89□□□□□ -0.35
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