Protein–RNA interactions for Protein: P38187

UBP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, yeastyeast

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP13P38187 RTN2YDL204W 1182 nt10.87□□□□□ -0.67
UBP13P38187 YML089CYML089C 369 nt10.87□□□□□ -0.67
UBP13P38187 TOM6YOR045W 186 nt10.87□□□□□ -0.67
UBP13P38187 ARP6YLR085C 1317 nt10.86□□□□□ -0.67
UBP13P38187 RPL4BYDR012W 1089 nt10.86□□□□□ -0.67
UBP13P38187 RPL4AYBR031W 1089 nt10.86□□□□□ -0.67
UBP13P38187 YKR005CYKR005C 1578 nt10.86□□□□□ -0.67
UBP13P38187 PRO1YDR300C 1287 nt10.85□□□□□ -0.67
UBP13P38187 CLB6YGR109C 1143 nt10.85□□□□□ -0.67
UBP13P38187 YGR259CYGR259C 441 nt10.84□□□□□ -0.67
UBP13P38187 PRP4YPR178W 1398 nt10.84□□□□□ -0.67
UBP13P38187 PEX2YJL210W 816 nt10.8□□□□□ -0.68
UBP13P38187 ATG15YCR068W 1563 nt10.8□□□□□ -0.68
UBP13P38187 UTH1YKR042W 1098 nt10.79□□□□□ -0.68
UBP13P38187 HIP1YGR191W 1812 nt10.79□□□□□ -0.68
UBP13P38187 PLB1YMR008C 1995 nt10.78□□□□□ -0.68
UBP13P38187 ALG12YNR030W 1656 nt10.78□□□□□ -0.68
UBP13P38187 GAP1YKR039W 1809 nt10.77□□□□□ -0.68
UBP13P38187 RPS14BYJL191W 417 nt10.77□□□□□ -0.69
UBP13P38187 BMT6YLR063W 1098 nt10.77□□□□□ -0.69
UBP13P38187 RPM1RPM1 483 nt10.76□□□□□ -0.69
UBP13P38187 DPS1YLL018C 1674 nt10.76□□□□□ -0.69
UBP13P38187 TIF6YPR016C 738 nt10.74□□□□□ -0.69
UBP13P38187 NRT1YOR071C 1797 nt10.74□□□□□ -0.69
UBP13P38187 MET28YIR017C 564 nt10.73□□□□□ -0.69
UBP13P38187 YMR226CYMR226C 804 nt10.72□□□□□ -0.69
UBP13P38187 RBG2YGR173W 1107 nt10.71□□□□□ -0.69
UBP13P38187 SDH5YOL071W 489 nt10.7□□□□□ -0.7
UBP13P38187 YLR111WYLR111W 333 nt10.68□□□□□ -0.7
UBP13P38187 IRC24YIR036C 792 nt10.66□□□□□ -0.7
UBP13P38187 TSC10YBR265W 963 nt10.66□□□□□ -0.7
UBP13P38187 AAC1YMR056C 930 nt10.63□□□□□ -0.71
UBP13P38187 FIT3YOR383C 615 nt10.63□□□□□ -0.71
UBP13P38187 UTR1YJR049C 1593 nt10.63□□□□□ -0.71
UBP13P38187 RAD23YEL037C 1197 nt10.62□□□□□ -0.71
UBP13P38187 SNF1YDR477W 1902 nt10.6□□□□□ -0.71
UBP13P38187 YGR012WYGR012W 1182 nt10.6□□□□□ -0.71
UBP13P38187 DIF1YLR437C 402 nt10.6□□□□□ -0.71
UBP13P38187 SAM35YHR083W 990 nt10.56□□□□□ -0.72
UBP13P38187 BIO5YNR056C 1686 nt10.55□□□□□ -0.72
UBP13P38187 YAR028WYAR028W 705 nt10.55□□□□□ -0.72
UBP13P38187 YLR279WYLR279W 390 nt10.55□□□□□ -0.72
UBP13P38187 PRM5YIL117C 957 nt10.53□□□□□ -0.72
UBP13P38187 ALP1YNL270C 1722 nt10.51□□□□□ -0.73
UBP13P38187 RIB3YDR487C 627 nt10.5□□□□□ -0.73
UBP13P38187 HSL7YBR133C 2484 nt10.49□□□□□ -0.73
UBP13P38187 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.49□□□□□ -0.73
UBP13P38187 NAR1YNL240C 1476 nt10.49□□□□□ -0.73
UBP13P38187 MSB4YOL112W 1479 nt10.49□□□□□ -0.73
UBP13P38187 MTG2YHR168W 1557 nt10.48□□□□□ -0.73
UBP13P38187 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.48□□□□□ -0.73
UBP13P38187 PBP1YGR178C 2169 nt10.46□□□□□ -0.73
UBP13P38187 AKR2YOR034C 2250 nt10.46□□□□□ -0.74
UBP13P38187 CAB5YDR196C 726 nt10.45□□□□□ -0.74
UBP13P38187 ZTA1YBR046C 1005 nt10.45□□□□□ -0.74
UBP13P38187 ALD4YOR374W 1560 nt10.44□□□□□ -0.74
UBP13P38187 SAM1YLR180W 1149 nt10.42□□□□□ -0.74
UBP13P38187 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.4□□□□□ -0.75
UBP13P38187 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.4□□□□□ -0.75
UBP13P38187 SED1YDR077W 1017 nt10.39□□□□□ -0.75
UBP13P38187 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.38□□□□□ -0.75
UBP13P38187 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.38□□□□□ -0.75
UBP13P38187 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.38□□□□□ -0.75
UBP13P38187 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.38□□□□□ -0.75
UBP13P38187 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.38□□□□□ -0.75
UBP13P38187 HIF1YLL022C 1158 nt10.37□□□□□ -0.75
UBP13P38187 LIP1YMR298W 453 nt10.37□□□□□ -0.75
UBP13P38187 DBP1YPL119C 1854 nt10.35□□□□□ -0.75
UBP13P38187 CYT2YKL087C 675 nt10.34□□□□□ -0.75
UBP13P38187 GND1YHR183W 1470 nt10.33□□□□□ -0.76
UBP13P38187 HXT1YHR094C 1713 nt10.33□□□□□ -0.76
UBP13P38187 LOT5YKL183W 921 nt10.31□□□□□ -0.76
UBP13P38187 FCY21YER060W 1587 nt10.3□□□□□ -0.76
UBP13P38187 APT2YDR441C 546 nt10.29□□□□□ -0.76
UBP13P38187 SMM1YNR015W 1155 nt10.28□□□□□ -0.76
UBP13P38187 YBL086CYBL086C 1401 nt10.27□□□□□ -0.77
UBP13P38187 YPI1YFR003C 468 nt10.27□□□□□ -0.77
UBP13P38187 LEU9YOR108W 1815 nt10.24□□□□□ -0.77
UBP13P38187 YPL251WYPL251W 303 nt10.24□□□□□ -0.77
UBP13P38187 BRR1YPR057W 1026 nt10.24□□□□□ -0.77
UBP13P38187 HEL2YDR266C 1920 nt10.24□□□□□ -0.77
UBP13P38187 UGA4YDL210W 1716 nt10.24□□□□□ -0.77
UBP13P38187 TOA2YKL058W 369 nt10.22□□□□□ -0.77
UBP13P38187 ADH1YOL086C 1047 nt10.22□□□□□ -0.77
UBP13P38187 MEP3YPR138C 1470 nt10.2□□□□□ -0.78
UBP13P38187 YAT1YAR035W 2064 nt10.19□□□□□ -0.78
UBP13P38187 ZRT3YKL175W 1512 nt10.19□□□□□ -0.78
UBP13P38187 SHY1YGR112W 1170 nt10.19□□□□□ -0.78
UBP13P38187 YNR029CYNR029C 1290 nt10.19□□□□□ -0.78
UBP13P38187 PRY1YJL079C 900 nt10.18□□□□□ -0.78
UBP13P38187 YJL195CYJL195C 702 nt10.18□□□□□ -0.78
UBP13P38187 YMR103CYMR103C 363 nt10.18□□□□□ -0.78
UBP13P38187 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.17□□□□□ -0.78
UBP13P38187 SFP1YLR403W 2052 nt10.16□□□□□ -0.78
UBP13P38187 FUN14YAL008W 597 nt10.16□□□□□ -0.78
UBP13P38187 SSN3YPL042C 1668 nt10.15□□□□□ -0.78
UBP13P38187 NPP1YCR026C 2229 nt10.14□□□□□ -0.79
UBP13P38187 GND2YGR256W 1479 nt10.14□□□□□ -0.79
UBP13P38187 CMP2YML057W 1815 nt10.13□□□□□ -0.79
UBP13P38187 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.2 ms