Protein–RNA interactions for Protein: P36000

APL2, AP-1 complex subunit beta-1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APL2P36000 HIP1YGR191W 1812 nt12.23□□□□□ -0.45
APL2P36000 SDH5YOL071W 489 nt12.23□□□□□ -0.45
APL2P36000 CLB6YGR109C 1143 nt12.22□□□□□ -0.45
APL2P36000 DUS1YML080W 1272 nt12.22□□□□□ -0.45
APL2P36000 AQY2YLL052C 450 nt12.21□□□□□ -0.45
APL2P36000 UTH1YKR042W 1098 nt12.2□□□□□ -0.46
APL2P36000 PRO1YDR300C 1287 nt12.19□□□□□ -0.46
APL2P36000 RAD23YEL037C 1197 nt12.19□□□□□ -0.46
APL2P36000 YGR012WYGR012W 1182 nt12.15□□□□□ -0.46
APL2P36000 TIF6YPR016C 738 nt12.15□□□□□ -0.46
APL2P36000 NRT1YOR071C 1797 nt12.14□□□□□ -0.47
APL2P36000 LSC2YGR244C 1284 nt12.13□□□□□ -0.47
APL2P36000 YCL074WYCL074W 927 nt12.12□□□□□ -0.47
APL2P36000 YML089CYML089C 369 nt12.12□□□□□ -0.47
APL2P36000 TSC10YBR265W 963 nt12.12□□□□□ -0.47
APL2P36000 RIB3YDR487C 627 nt12.1□□□□□ -0.47
APL2P36000 YLR279WYLR279W 390 nt12.1□□□□□ -0.47
APL2P36000 ATG15YCR068W 1563 nt12.08□□□□□ -0.48
APL2P36000 MET28YIR017C 564 nt12.07□□□□□ -0.48
APL2P36000 ARP6YLR085C 1317 nt12.07□□□□□ -0.48
APL2P36000 MSB4YOL112W 1479 nt12.05□□□□□ -0.48
APL2P36000 YLR349WYLR349W 507 nt12.02□□□□□ -0.49
APL2P36000 YNR029CYNR029C 1290 nt12□□□□□ -0.49
APL2P36000 STE4YOR212W 1272 nt11.99□□□□□ -0.49
APL2P36000 GAP1YKR039W 1809 nt11.99□□□□□ -0.49
APL2P36000 FUR4YBR021W 1902 nt11.98□□□□□ -0.49
APL2P36000 PLB1YMR008C 1995 nt11.95□□□□□ -0.5
APL2P36000 FUN14YAL008W 597 nt11.94□□□□□ -0.5
APL2P36000 ADH1YOL086C 1047 nt11.94□□□□□ -0.5
APL2P36000 YJL195CYJL195C 702 nt11.93□□□□□ -0.5
APL2P36000 FIT3YOR383C 615 nt11.92□□□□□ -0.5
APL2P36000 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt11.92□□□□□ -0.5
APL2P36000 RTN2YDL204W 1182 nt11.89□□□□□ -0.51
APL2P36000 RPM1RPM1 483 nt11.89□□□□□ -0.51
APL2P36000 ZTA1YBR046C 1005 nt11.88□□□□□ -0.51
APL2P36000 DIF1YLR437C 402 nt11.86□□□□□ -0.51
APL2P36000 GND1YHR183W 1470 nt11.84□□□□□ -0.51
APL2P36000 ADH7YCR105W 1086 nt11.83□□□□□ -0.52
APL2P36000 LOT5YKL183W 921 nt11.83□□□□□ -0.52
APL2P36000 YPI1YFR003C 468 nt11.82□□□□□ -0.52
APL2P36000 MTG2YHR168W 1557 nt11.81□□□□□ -0.52
APL2P36000 PAU15YIR041W 375 nt11.81□□□□□ -0.52
APL2P36000 AAC1YMR056C 930 nt11.81□□□□□ -0.52
APL2P36000 UTR1YJR049C 1593 nt11.8□□□□□ -0.52
APL2P36000 YAR028WYAR028W 705 nt11.79□□□□□ -0.52
APL2P36000 APT2YDR441C 546 nt11.78□□□□□ -0.52
APL2P36000 ALP1YNL270C 1722 nt11.77□□□□□ -0.53
APL2P36000 AKR2YOR034C 2250 nt11.76□□□□□ -0.53
APL2P36000 GPN2YOR262W 1044 nt11.76□□□□□ -0.53
APL2P36000 YKR005CYKR005C 1578 nt11.75□□□□□ -0.53
APL2P36000 SMM1YNR015W 1155 nt11.75□□□□□ -0.53
APL2P36000 YEL008WYEL008W 381 nt11.74□□□□□ -0.53
APL2P36000 YGR259CYGR259C 441 nt11.74□□□□□ -0.53
APL2P36000 FCY21YER060W 1587 nt11.71□□□□□ -0.53
APL2P36000 YER190C-AYER190C-A 576 nt11.66□□□□□ -0.54
APL2P36000 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt11.66□□□□□ -0.54
APL2P36000 YML133W-AYML133W-A 576 nt11.66□□□□□ -0.54
APL2P36000 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt11.66□□□□□ -0.54
APL2P36000 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt11.66□□□□□ -0.54
APL2P36000 RIB2YOL066C 1776 nt11.66□□□□□ -0.54
APL2P36000 CPD1YGR247W 720 nt11.65□□□□□ -0.54
APL2P36000 UGA4YDL210W 1716 nt11.64□□□□□ -0.55
APL2P36000 HSP60YLR259C 1719 nt11.63□□□□□ -0.55
APL2P36000 PRM5YIL117C 957 nt11.62□□□□□ -0.55
APL2P36000 PRP4YPR178W 1398 nt11.62□□□□□ -0.55
APL2P36000 ESS1YJR017C 513 nt11.61□□□□□ -0.55
APL2P36000 LSB3YFR024C-A 1380 nt11.61□□□□□ -0.55
APL2P36000 PRY1YJL079C 900 nt11.59□□□□□ -0.55
APL2P36000 HXT12YIL170W 1374 nt11.58□□□□□ -0.56
APL2P36000 DPS1YLL018C 1674 nt11.56□□□□□ -0.56
APL2P36000 SED1YDR077W 1017 nt11.54□□□□□ -0.56
APL2P36000 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt11.53□□□□□ -0.56
APL2P36000 YJL055WYJL055W 738 nt11.52□□□□□ -0.57
APL2P36000 YPL251WYPL251W 303 nt11.51□□□□□ -0.57
APL2P36000 VRG4YGL225W 1014 nt11.5□□□□□ -0.57
APL2P36000 ALD4YOR374W 1560 nt11.5□□□□□ -0.57
APL2P36000 LIP1YMR298W 453 nt11.49□□□□□ -0.57
APL2P36000 DBP1YPL119C 1854 nt11.49□□□□□ -0.57
APL2P36000 SAM35YHR083W 990 nt11.47□□□□□ -0.57
APL2P36000 YBL086CYBL086C 1401 nt11.45□□□□□ -0.58
APL2P36000 BMT6YLR063W 1098 nt11.45□□□□□ -0.58
APL2P36000 IRC24YIR036C 792 nt11.44□□□□□ -0.58
APL2P36000 PGC1YPL206C 966 nt11.44□□□□□ -0.58
APL2P36000 SNF1YDR477W 1902 nt11.44□□□□□ -0.58
APL2P36000 CSM1YCR086W 573 nt11.43□□□□□ -0.58
APL2P36000 YMR103CYMR103C 363 nt11.41□□□□□ -0.58
APL2P36000 LEU9YOR108W 1815 nt11.41□□□□□ -0.58
APL2P36000 UME6YDR207C 2511 nt11.4□□□□□ -0.59
APL2P36000 SEN2YLR105C 1134 nt11.39□□□□□ -0.59
APL2P36000 PUP1YOR157C 786 nt11.39□□□□□ -0.59
APL2P36000 BRR1YPR057W 1026 nt11.39□□□□□ -0.59
APL2P36000 CCT5YJR064W 1689 nt11.39□□□□□ -0.59
APL2P36000 MEP3YPR138C 1470 nt11.38□□□□□ -0.59
APL2P36000 YJL225CYJL225C 5277 nt11.38□□□□□ -0.59
APL2P36000 PAU5YFL020C 369 nt11.37□□□□□ -0.59
APL2P36000 HXT1YHR094C 1713 nt11.37□□□□□ -0.59
APL2P36000 YBR232CYBR232C 360 nt11.36□□□□□ -0.59
APL2P36000 HIF1YLL022C 1158 nt11.34□□□□□ -0.59
APL2P36000 SAM3YPL274W 1764 nt11.33□□□□□ -0.59
APL2P36000 GAL3YDR009W 1563 nt11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.1 ms