Protein–RNA interactions for Protein: P34077

NIC96, Nucleoporin NIC96, yeastyeast

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIC96P34077 DAT1YML113W 747 nt9.29□□□□□ -0.92
NIC96P34077 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.28□□□□□ -0.92
NIC96P34077 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.28□□□□□ -0.92
NIC96P34077 YGL114WYGL114W 2178 nt9.28□□□□□ -0.92
NIC96P34077 RRT5YFR032C 870 nt9.27□□□□□ -0.93
NIC96P34077 PAU7YAR020C 168 nt9.26□□□□□ -0.93
NIC96P34077 PRE6YOL038W 765 nt9.26□□□□□ -0.93
NIC96P34077 MAE1YKL029C 2010 nt9.24□□□□□ -0.93
NIC96P34077 MET2YNL277W 1461 nt9.24□□□□□ -0.93
NIC96P34077 YCR102CYCR102C 1107 nt9.24□□□□□ -0.93
NIC96P34077 YDR306CYDR306C 1437 nt9.23□□□□□ -0.93
NIC96P34077 MUP1YGR055W 1725 nt9.2□□□□□ -0.94
NIC96P34077 RTN2YDL204W 1182 nt9.2□□□□□ -0.94
NIC96P34077 PAU16YKL224C 372 nt9.17□□□□□ -0.94
NIC96P34077 NBP35YGL091C 987 nt9.15□□□□□ -0.94
NIC96P34077 SFP1YLR403W 2052 nt9.13□□□□□ -0.95
NIC96P34077 PUS7YOR243C 2031 nt9.12□□□□□ -0.95
NIC96P34077 SHB17YKR043C 816 nt9.11□□□□□ -0.95
NIC96P34077 MIR1YJR077C 936 nt9.1□□□□□ -0.95
NIC96P34077 GID7YCL039W 2238 nt9.08□□□□□ -0.96
NIC96P34077 TIR3YIL011W 810 nt9.07□□□□□ -0.96
NIC96P34077 ACO2YJL200C 2370 nt9.06□□□□□ -0.96
NIC96P34077 YDR010CYDR010C 333 nt9.06□□□□□ -0.96
NIC96P34077 THI74YDR438W 1113 nt9.06□□□□□ -0.96
NIC96P34077 NAT4YMR069W 858 nt9.06□□□□□ -0.96
NIC96P34077 HOL1YNR055C 1761 nt9.06□□□□□ -0.96
NIC96P34077 ARP6YLR085C 1317 nt9.05□□□□□ -0.96
NIC96P34077 HEM14YER014W 1620 nt9.05□□□□□ -0.96
NIC96P34077 PAB1YER165W 1734 nt9.05□□□□□ -0.96
NIC96P34077 HIF1YLL022C 1158 nt9.05□□□□□ -0.96
NIC96P34077 PLB1YMR008C 1995 nt9.04□□□□□ -0.96
NIC96P34077 UBA4YHR111W 1323 nt9.04□□□□□ -0.96
NIC96P34077 LSC2YGR244C 1284 nt9.03□□□□□ -0.96
NIC96P34077 RET2YFR051C 1641 nt9.02□□□□□ -0.96
NIC96P34077 ESBP6YNL125C 2022 nt9.02□□□□□ -0.97
NIC96P34077 PHO89YBR296C 1725 nt9□□□□□ -0.97
NIC96P34077 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9□□□□□ -0.97
NIC96P34077 YSR3YKR053C 1215 nt9□□□□□ -0.97
NIC96P34077 MSF1YPR047W 1410 nt8.99□□□□□ -0.97
NIC96P34077 SHH4YLR164W 507 nt8.99□□□□□ -0.97
NIC96P34077 ALD4YOR374W 1560 nt8.99□□□□□ -0.97
NIC96P34077 SFA1YDL168W 1161 nt8.97□□□□□ -0.97
NIC96P34077 PRO1YDR300C 1287 nt8.97□□□□□ -0.97
NIC96P34077 GAP1YKR039W 1809 nt8.96□□□□□ -0.97
NIC96P34077 YML089CYML089C 369 nt8.96□□□□□ -0.98
NIC96P34077 ATG15YCR068W 1563 nt8.95□□□□□ -0.98
NIC96P34077 YCR087WYCR087W 516 nt8.95□□□□□ -0.98
NIC96P34077 POM34YLR018C 900 nt8.95□□□□□ -0.98
NIC96P34077 TPO4YOR273C 1980 nt8.95□□□□□ -0.98
NIC96P34077 UGA4YDL210W 1716 nt8.94□□□□□ -0.98
NIC96P34077 NPP1YCR026C 2229 nt8.94□□□□□ -0.98
NIC96P34077 YMR209CYMR209C 1374 nt8.94□□□□□ -0.98
NIC96P34077 HMG2YLR450W 3138 nt8.94□□□□□ -0.98
NIC96P34077 MRP20YDR405W 792 nt8.92□□□□□ -0.98
NIC96P34077 SAM35YHR083W 990 nt8.91□□□□□ -0.98
NIC96P34077 PRM5YIL117C 957 nt8.91□□□□□ -0.98
NIC96P34077 TOM6YOR045W 186 nt8.91□□□□□ -0.98
NIC96P34077 UTR1YJR049C 1593 nt8.9□□□□□ -0.98
NIC96P34077 YGL034CYGL034C 366 nt8.9□□□□□ -0.98
NIC96P34077 NAS6YGR232W 687 nt8.9□□□□□ -0.98
NIC96P34077 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt8.89□□□□□ -0.99
NIC96P34077 XYL2YLR070C 1071 nt8.89□□□□□ -0.99
NIC96P34077 COQ2YNR041C 1119 nt8.88□□□□□ -0.99
NIC96P34077 ZRT3YKL175W 1512 nt8.88□□□□□ -0.99
NIC96P34077 PEX2YJL210W 816 nt8.86□□□□□ -0.99
NIC96P34077 YNL024CYNL024C 741 nt8.86□□□□□ -0.99
NIC96P34077 DTR1YBR180W 1719 nt8.85□□□□□ -0.99
NIC96P34077 AIM45YPR004C 1035 nt8.85□□□□□ -0.99
NIC96P34077 HIS2YFR025C 1008 nt8.82□□□□□ -1
NIC96P34077 HIP1YGR191W 1812 nt8.82□□□□□ -1
NIC96P34077 ILV3YJR016C 1758 nt8.81□□□□□ -1
NIC96P34077 YHL008CYHL008C 1884 nt8.81□□□□□ -1
NIC96P34077 RPL4BYDR012W 1089 nt8.81□□□□□ -1
NIC96P34077 RPL4AYBR031W 1089 nt8.81□□□□□ -1
NIC96P34077 TIF6YPR016C 738 nt8.81□□□□□ -1
NIC96P34077 UTH1YKR042W 1098 nt8.8□□□□□ -1
NIC96P34077 DIF1YLR437C 402 nt8.8□□□□□ -1
NIC96P34077 GNP1YDR508C 1992 nt8.8□□□□□ -1
NIC96P34077 MET28YIR017C 564 nt8.79□□□□□ -1
NIC96P34077 YJL067WYJL067W 351 nt8.79□□□□□ -1
NIC96P34077 RBG1YAL036C 1110 nt8.79□□□□□ -1
NIC96P34077 NRT1YOR071C 1797 nt8.78□□□□□ -1
NIC96P34077 UGP1YKL035W 1500 nt8.77□□□□□ -1.01
NIC96P34077 PSD1YNL169C 1503 nt8.75□□□□□ -1.01
NIC96P34077 YOR325WYOR325W 474 nt8.75□□□□□ -1.01
NIC96P34077 COQ8YGL119W 1506 nt8.75□□□□□ -1.01
NIC96P34077 URA8YJR103W 1737 nt8.74□□□□□ -1.01
NIC96P34077 ILV2YMR108W 2064 nt8.74□□□□□ -1.01
NIC96P34077 YAR028WYAR028W 705 nt8.74□□□□□ -1.01
NIC96P34077 RPS14BYJL191W 417 nt8.73□□□□□ -1.01
NIC96P34077 FIT3YOR383C 615 nt8.71□□□□□ -1.02
NIC96P34077 CYT1YOR065W 930 nt8.7□□□□□ -1.02
NIC96P34077 RFC1YOR217W 2586 nt8.7□□□□□ -1.02
NIC96P34077 HXT1YHR094C 1713 nt8.7□□□□□ -1.02
NIC96P34077 HXK1YFR053C 1458 nt8.68□□□□□ -1.02
NIC96P34077 SED1YDR077W 1017 nt8.67□□□□□ -1.02
NIC96P34077 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.67□□□□□ -1.02
NIC96P34077 AKR2YOR034C 2250 nt8.66□□□□□ -1.02
NIC96P34077 DBP1YPL119C 1854 nt8.66□□□□□ -1.02
NIC96P34077 LIP1YMR298W 453 nt8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.3 ms