Protein–RNA interactions for Protein: P0CX23

RPL20A, 60S ribosomal protein L20-A, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL20AP0CX23 POM34YLR018C 900 nt9.16□□□□□ -0.94
RPL20AP0CX23 RTN2YDL204W 1182 nt9.15□□□□□ -0.94
RPL20AP0CX23 DPS1YLL018C 1674 nt9.15□□□□□ -0.94
RPL20AP0CX23 ARP6YLR085C 1317 nt9.14□□□□□ -0.95
RPL20AP0CX23 TOM6YOR045W 186 nt9.14□□□□□ -0.95
RPL20AP0CX23 PRO1YDR300C 1287 nt9.13□□□□□ -0.95
RPL20AP0CX23 RPL4BYDR012W 1089 nt9.12□□□□□ -0.95
RPL20AP0CX23 YML089CYML089C 369 nt9.12□□□□□ -0.95
RPL20AP0CX23 RPL4AYBR031W 1089 nt9.12□□□□□ -0.95
RPL20AP0CX23 BMT6YLR063W 1098 nt9.1□□□□□ -0.95
RPL20AP0CX23 CLB6YGR109C 1143 nt9.09□□□□□ -0.95
RPL20AP0CX23 PLB1YMR008C 1995 nt9.08□□□□□ -0.96
RPL20AP0CX23 HIP1YGR191W 1812 nt9.08□□□□□ -0.96
RPL20AP0CX23 PEX2YJL210W 816 nt9.08□□□□□ -0.96
RPL20AP0CX23 ATG15YCR068W 1563 nt9.07□□□□□ -0.96
RPL20AP0CX23 RPS14BYJL191W 417 nt9.07□□□□□ -0.96
RPL20AP0CX23 AAC1YMR056C 930 nt9.07□□□□□ -0.96
RPL20AP0CX23 GAP1YKR039W 1809 nt9.06□□□□□ -0.96
RPL20AP0CX23 UTH1YKR042W 1098 nt9.06□□□□□ -0.96
RPL20AP0CX23 TIF6YPR016C 738 nt9.04□□□□□ -0.96
RPL20AP0CX23 SNF1YDR477W 1902 nt9.03□□□□□ -0.96
RPL20AP0CX23 IRC24YIR036C 792 nt9.03□□□□□ -0.96
RPL20AP0CX23 NRT1YOR071C 1797 nt9.01□□□□□ -0.97
RPL20AP0CX23 RBG2YGR173W 1107 nt9.01□□□□□ -0.97
RPL20AP0CX23 MET28YIR017C 564 nt9.01□□□□□ -0.97
RPL20AP0CX23 RPM1RPM1 483 nt9□□□□□ -0.97
RPL20AP0CX23 YMR226CYMR226C 804 nt8.99□□□□□ -0.97
RPL20AP0CX23 SDH5YOL071W 489 nt8.97□□□□□ -0.97
RPL20AP0CX23 ALG12YNR030W 1656 nt8.97□□□□□ -0.97
RPL20AP0CX23 UTR1YJR049C 1593 nt8.95□□□□□ -0.98
RPL20AP0CX23 YLR111WYLR111W 333 nt8.95□□□□□ -0.98
RPL20AP0CX23 TSC10YBR265W 963 nt8.95□□□□□ -0.98
RPL20AP0CX23 BIO5YNR056C 1686 nt8.93□□□□□ -0.98
RPL20AP0CX23 RAD23YEL037C 1197 nt8.92□□□□□ -0.98
RPL20AP0CX23 DIF1YLR437C 402 nt8.92□□□□□ -0.98
RPL20AP0CX23 FIT3YOR383C 615 nt8.92□□□□□ -0.98
RPL20AP0CX23 YGR012WYGR012W 1182 nt8.91□□□□□ -0.98
RPL20AP0CX23 PRM5YIL117C 957 nt8.9□□□□□ -0.98
RPL20AP0CX23 YLR279WYLR279W 390 nt8.89□□□□□ -0.99
RPL20AP0CX23 YAR028WYAR028W 705 nt8.87□□□□□ -0.99
RPL20AP0CX23 CAB5YDR196C 726 nt8.84□□□□□ -0.99
RPL20AP0CX23 SAM35YHR083W 990 nt8.84□□□□□ -0.99
RPL20AP0CX23 MSB4YOL112W 1479 nt8.83□□□□□ -1
RPL20AP0CX23 ALP1YNL270C 1722 nt8.83□□□□□ -1
RPL20AP0CX23 MTG2YHR168W 1557 nt8.83□□□□□ -1
RPL20AP0CX23 RIB3YDR487C 627 nt8.83□□□□□ -1
RPL20AP0CX23 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt8.83□□□□□ -1
RPL20AP0CX23 ZTA1YBR046C 1005 nt8.82□□□□□ -1
RPL20AP0CX23 AKR2YOR034C 2250 nt8.8□□□□□ -1
RPL20AP0CX23 ALD4YOR374W 1560 nt8.79□□□□□ -1
RPL20AP0CX23 HIF1YLL022C 1158 nt8.79□□□□□ -1
RPL20AP0CX23 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.78□□□□□ -1
RPL20AP0CX23 PBP1YGR178C 2169 nt8.76□□□□□ -1.01
RPL20AP0CX23 SAM1YLR180W 1149 nt8.75□□□□□ -1.01
RPL20AP0CX23 SED1YDR077W 1017 nt8.74□□□□□ -1.01
RPL20AP0CX23 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.74□□□□□ -1.01
RPL20AP0CX23 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.74□□□□□ -1.01
RPL20AP0CX23 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.74□□□□□ -1.01
RPL20AP0CX23 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.74□□□□□ -1.01
RPL20AP0CX23 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.74□□□□□ -1.01
RPL20AP0CX23 NAR1YNL240C 1476 nt8.74□□□□□ -1.01
RPL20AP0CX23 DBP1YPL119C 1854 nt8.73□□□□□ -1.01
RPL20AP0CX23 LIP1YMR298W 453 nt8.71□□□□□ -1.02
RPL20AP0CX23 MCH5YOR306C 1566 nt8.7□□□□□ -1.02
RPL20AP0CX23 CYT2YKL087C 675 nt8.7□□□□□ -1.02
RPL20AP0CX23 GND1YHR183W 1470 nt8.7□□□□□ -1.02
RPL20AP0CX23 UME6YDR207C 2511 nt8.69□□□□□ -1.02
RPL20AP0CX23 HXT1YHR094C 1713 nt8.68□□□□□ -1.02
RPL20AP0CX23 FCY21YER060W 1587 nt8.67□□□□□ -1.02
RPL20AP0CX23 YBL086CYBL086C 1401 nt8.66□□□□□ -1.02
RPL20AP0CX23 LOT5YKL183W 921 nt8.66□□□□□ -1.02
RPL20AP0CX23 SMM1YNR015W 1155 nt8.64□□□□□ -1.03
RPL20AP0CX23 YPL251WYPL251W 303 nt8.64□□□□□ -1.03
RPL20AP0CX23 UGA4YDL210W 1716 nt8.63□□□□□ -1.03
RPL20AP0CX23 APT2YDR441C 546 nt8.63□□□□□ -1.03
RPL20AP0CX23 YPI1YFR003C 468 nt8.63□□□□□ -1.03
RPL20AP0CX23 LEU9YOR108W 1815 nt8.63□□□□□ -1.03
RPL20AP0CX23 BRR1YPR057W 1026 nt8.61□□□□□ -1.03
RPL20AP0CX23 ADH1YOL086C 1047 nt8.6□□□□□ -1.03
RPL20AP0CX23 SHY1YGR112W 1170 nt8.58□□□□□ -1.04
RPL20AP0CX23 TOA2YKL058W 369 nt8.58□□□□□ -1.04
RPL20AP0CX23 ZRT3YKL175W 1512 nt8.58□□□□□ -1.04
RPL20AP0CX23 PRY1YJL079C 900 nt8.57□□□□□ -1.04
RPL20AP0CX23 YMR103CYMR103C 363 nt8.57□□□□□ -1.04
RPL20AP0CX23 YNR029CYNR029C 1290 nt8.57□□□□□ -1.04
RPL20AP0CX23 MEP3YPR138C 1470 nt8.57□□□□□ -1.04
RPL20AP0CX23 YJL195CYJL195C 702 nt8.55□□□□□ -1.04
RPL20AP0CX23 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.55□□□□□ -1.04
RPL20AP0CX23 FRE6YLL051C 2139 nt8.54□□□□□ -1.04
RPL20AP0CX23 UFO1YML088W 2007 nt8.54□□□□□ -1.04
RPL20AP0CX23 FUN14YAL008W 597 nt8.53□□□□□ -1.04
RPL20AP0CX23 YAT1YAR035W 2064 nt8.53□□□□□ -1.04
RPL20AP0CX23 GND2YGR256W 1479 nt8.52□□□□□ -1.05
RPL20AP0CX23 HXT12YIL170W 1374 nt8.51□□□□□ -1.05
RPL20AP0CX23 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.51□□□□□ -1.05
RPL20AP0CX23 RIB2YOL066C 1776 nt8.5□□□□□ -1.05
RPL20AP0CX23 YJL067WYJL067W 351 nt8.5□□□□□ -1.05
RPL20AP0CX23 URA6YKL024C 615 nt8.5□□□□□ -1.05
RPL20AP0CX23 VRG4YGL225W 1014 nt8.49□□□□□ -1.05
RPL20AP0CX23 CSM1YCR086W 573 nt8.48□□□□□ -1.05
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