Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LYVE1Q9Y5Y7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms