Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SRP68Q9UHB9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRP68Q9UHB9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms