Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CDK12Q9NYV4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK12Q9NYV4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms