Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRA6Q9BX79 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms