Protein–RNA interactions for Protein: Q99797

MIPEP, Mitochondrial intermediate peptidase, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPEPQ99797 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms