Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HDXQ7Z353 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms