Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC93Q567U6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms